Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWD8

TMEM248, Transmembrane protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM248Q9NWD8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMEM248Q9NWD8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMEM248Q9NWD8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMEM248Q9NWD8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMEM248Q9NWD8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM248Q9NWD8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM248Q9NWD8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM248Q9NWD8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM248Q9NWD8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM248Q9NWD8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM248Q9NWD8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM248Q9NWD8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM248Q9NWD8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM248Q9NWD8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM248Q9NWD8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM248Q9NWD8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM248Q9NWD8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM248Q9NWD8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM248Q9NWD8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM248Q9NWD8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM248Q9NWD8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM248Q9NWD8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMEM248Q9NWD8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMEM248Q9NWD8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TMEM248Q9NWD8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TMEM248Q9NWD8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM248Q9NWD8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM248Q9NWD8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM248Q9NWD8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM248Q9NWD8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM248Q9NWD8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM248Q9NWD8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM248Q9NWD8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM248Q9NWD8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM248Q9NWD8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM248Q9NWD8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM248Q9NWD8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM248Q9NWD8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM248Q9NWD8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM248Q9NWD8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM248Q9NWD8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM248Q9NWD8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM248Q9NWD8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM248Q9NWD8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM248Q9NWD8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM248Q9NWD8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM248Q9NWD8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM248Q9NWD8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM248Q9NWD8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM248Q9NWD8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM248Q9NWD8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM248Q9NWD8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM248Q9NWD8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM248Q9NWD8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM248Q9NWD8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM248Q9NWD8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM248Q9NWD8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM248Q9NWD8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM248Q9NWD8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM248Q9NWD8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM248Q9NWD8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM248Q9NWD8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM248Q9NWD8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM248Q9NWD8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM248Q9NWD8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM248Q9NWD8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM248Q9NWD8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM248Q9NWD8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM248Q9NWD8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM248Q9NWD8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM248Q9NWD8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM248Q9NWD8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM248Q9NWD8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM248Q9NWD8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM248Q9NWD8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM248Q9NWD8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM248Q9NWD8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM248Q9NWD8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM248Q9NWD8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM248Q9NWD8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM248Q9NWD8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM248Q9NWD8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM248Q9NWD8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM248Q9NWD8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM248Q9NWD8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM248Q9NWD8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM248Q9NWD8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM248Q9NWD8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM248Q9NWD8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM248Q9NWD8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM248Q9NWD8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM248Q9NWD8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM248Q9NWD8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM248Q9NWD8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM248Q9NWD8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM248Q9NWD8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM248Q9NWD8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM248Q9NWD8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM248Q9NWD8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM248Q9NWD8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms