Protein–RNA interactions for Protein: Q92597

NDRG1, Protein NDRG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDRG1Q92597 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NDRG1Q92597 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NDRG1Q92597 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NDRG1Q92597 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NDRG1Q92597 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NDRG1Q92597 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NDRG1Q92597 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NDRG1Q92597 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NDRG1Q92597 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NDRG1Q92597 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NDRG1Q92597 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NDRG1Q92597 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NDRG1Q92597 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NDRG1Q92597 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NDRG1Q92597 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NDRG1Q92597 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NDRG1Q92597 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NDRG1Q92597 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NDRG1Q92597 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NDRG1Q92597 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NDRG1Q92597 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NDRG1Q92597 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NDRG1Q92597 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NDRG1Q92597 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NDRG1Q92597 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NDRG1Q92597 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NDRG1Q92597 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
NDRG1Q92597 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NDRG1Q92597 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NDRG1Q92597 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NDRG1Q92597 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NDRG1Q92597 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NDRG1Q92597 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NDRG1Q92597 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NDRG1Q92597 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NDRG1Q92597 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NDRG1Q92597 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NDRG1Q92597 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NDRG1Q92597 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
NDRG1Q92597 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NDRG1Q92597 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NDRG1Q92597 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NDRG1Q92597 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NDRG1Q92597 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NDRG1Q92597 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NDRG1Q92597 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NDRG1Q92597 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NDRG1Q92597 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NDRG1Q92597 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NDRG1Q92597 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NDRG1Q92597 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NDRG1Q92597 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NDRG1Q92597 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NDRG1Q92597 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NDRG1Q92597 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NDRG1Q92597 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NDRG1Q92597 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NDRG1Q92597 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NDRG1Q92597 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NDRG1Q92597 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NDRG1Q92597 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NDRG1Q92597 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NDRG1Q92597 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NDRG1Q92597 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
NDRG1Q92597 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
NDRG1Q92597 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
NDRG1Q92597 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NDRG1Q92597 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NDRG1Q92597 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
NDRG1Q92597 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NDRG1Q92597 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NDRG1Q92597 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NDRG1Q92597 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NDRG1Q92597 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NDRG1Q92597 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
NDRG1Q92597 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NDRG1Q92597 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NDRG1Q92597 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NDRG1Q92597 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NDRG1Q92597 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NDRG1Q92597 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NDRG1Q92597 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NDRG1Q92597 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NDRG1Q92597 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NDRG1Q92597 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NDRG1Q92597 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NDRG1Q92597 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NDRG1Q92597 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NDRG1Q92597 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NDRG1Q92597 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NDRG1Q92597 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NDRG1Q92597 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NDRG1Q92597 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NDRG1Q92597 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NDRG1Q92597 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NDRG1Q92597 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NDRG1Q92597 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NDRG1Q92597 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NDRG1Q92597 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NDRG1Q92597 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms