Protein–RNA interactions for Protein: Q6U841

SLC4A10, Sodium-driven chloride bicarbonate exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A10Q6U841 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
SLC4A10Q6U841 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
SLC4A10Q6U841 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
SLC4A10Q6U841 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.68
SLC4A10Q6U841 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
SLC4A10Q6U841 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
SLC4A10Q6U841 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC31.76■■■□□ 2.67
SLC4A10Q6U841 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
SLC4A10Q6U841 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC31.76■■■□□ 2.67
SLC4A10Q6U841 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
SLC4A10Q6U841 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
SLC4A10Q6U841 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
SLC4A10Q6U841 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
SLC4A10Q6U841 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
SLC4A10Q6U841 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
SLC4A10Q6U841 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
SLC4A10Q6U841 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
SLC4A10Q6U841 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
SLC4A10Q6U841 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
SLC4A10Q6U841 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
SLC4A10Q6U841 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
SLC4A10Q6U841 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
SLC4A10Q6U841 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
SLC4A10Q6U841 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
SLC4A10Q6U841 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
SLC4A10Q6U841 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
SLC4A10Q6U841 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
SLC4A10Q6U841 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
SLC4A10Q6U841 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
SLC4A10Q6U841 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
SLC4A10Q6U841 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
SLC4A10Q6U841 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC31.7■■■□□ 2.67
SLC4A10Q6U841 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
SLC4A10Q6U841 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
SLC4A10Q6U841 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
SLC4A10Q6U841 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
SLC4A10Q6U841 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
SLC4A10Q6U841 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
SLC4A10Q6U841 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
SLC4A10Q6U841 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
SLC4A10Q6U841 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
SLC4A10Q6U841 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
SLC4A10Q6U841 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
SLC4A10Q6U841 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
SLC4A10Q6U841 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
SLC4A10Q6U841 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
SLC4A10Q6U841 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
SLC4A10Q6U841 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
SLC4A10Q6U841 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
SLC4A10Q6U841 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
SLC4A10Q6U841 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
SLC4A10Q6U841 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
SLC4A10Q6U841 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
SLC4A10Q6U841 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
SLC4A10Q6U841 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
SLC4A10Q6U841 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
SLC4A10Q6U841 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
SLC4A10Q6U841 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
SLC4A10Q6U841 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
SLC4A10Q6U841 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
SLC4A10Q6U841 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
SLC4A10Q6U841 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
SLC4A10Q6U841 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
SLC4A10Q6U841 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
SLC4A10Q6U841 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
SLC4A10Q6U841 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
SLC4A10Q6U841 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
SLC4A10Q6U841 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
SLC4A10Q6U841 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
SLC4A10Q6U841 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
SLC4A10Q6U841 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
SLC4A10Q6U841 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
SLC4A10Q6U841 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
SLC4A10Q6U841 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
SLC4A10Q6U841 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
SLC4A10Q6U841 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
SLC4A10Q6U841 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
SLC4A10Q6U841 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
SLC4A10Q6U841 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
SLC4A10Q6U841 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
SLC4A10Q6U841 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
SLC4A10Q6U841 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
SLC4A10Q6U841 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
SLC4A10Q6U841 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
SLC4A10Q6U841 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
SLC4A10Q6U841 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
SLC4A10Q6U841 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
SLC4A10Q6U841 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
SLC4A10Q6U841 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SLC4A10Q6U841 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
SLC4A10Q6U841 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
SLC4A10Q6U841 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SLC4A10Q6U841 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SLC4A10Q6U841 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.64
SLC4A10Q6U841 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
SLC4A10Q6U841 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
SLC4A10Q6U841 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
SLC4A10Q6U841 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SLC4A10Q6U841 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC31.49■■■□□ 2.63
SLC4A10Q6U841 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms