Protein–RNA interactions for Protein: Q32NC0

C18orf21, UPF0711 protein C18orf21, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf21Q32NC0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
C18orf21Q32NC0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
C18orf21Q32NC0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
C18orf21Q32NC0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C18orf21Q32NC0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C18orf21Q32NC0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C18orf21Q32NC0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C18orf21Q32NC0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C18orf21Q32NC0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
C18orf21Q32NC0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C18orf21Q32NC0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C18orf21Q32NC0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
C18orf21Q32NC0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C18orf21Q32NC0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C18orf21Q32NC0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C18orf21Q32NC0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C18orf21Q32NC0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C18orf21Q32NC0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C18orf21Q32NC0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C18orf21Q32NC0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C18orf21Q32NC0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C18orf21Q32NC0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C18orf21Q32NC0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C18orf21Q32NC0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C18orf21Q32NC0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
C18orf21Q32NC0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C18orf21Q32NC0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C18orf21Q32NC0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C18orf21Q32NC0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C18orf21Q32NC0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C18orf21Q32NC0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C18orf21Q32NC0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C18orf21Q32NC0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C18orf21Q32NC0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C18orf21Q32NC0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C18orf21Q32NC0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C18orf21Q32NC0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C18orf21Q32NC0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C18orf21Q32NC0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C18orf21Q32NC0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C18orf21Q32NC0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C18orf21Q32NC0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C18orf21Q32NC0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C18orf21Q32NC0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C18orf21Q32NC0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C18orf21Q32NC0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C18orf21Q32NC0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C18orf21Q32NC0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C18orf21Q32NC0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C18orf21Q32NC0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C18orf21Q32NC0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C18orf21Q32NC0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C18orf21Q32NC0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C18orf21Q32NC0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C18orf21Q32NC0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C18orf21Q32NC0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C18orf21Q32NC0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C18orf21Q32NC0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
C18orf21Q32NC0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C18orf21Q32NC0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C18orf21Q32NC0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
C18orf21Q32NC0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C18orf21Q32NC0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
C18orf21Q32NC0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C18orf21Q32NC0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C18orf21Q32NC0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C18orf21Q32NC0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C18orf21Q32NC0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C18orf21Q32NC0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C18orf21Q32NC0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C18orf21Q32NC0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
C18orf21Q32NC0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
C18orf21Q32NC0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C18orf21Q32NC0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C18orf21Q32NC0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C18orf21Q32NC0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C18orf21Q32NC0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C18orf21Q32NC0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C18orf21Q32NC0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C18orf21Q32NC0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C18orf21Q32NC0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C18orf21Q32NC0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C18orf21Q32NC0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C18orf21Q32NC0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C18orf21Q32NC0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C18orf21Q32NC0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C18orf21Q32NC0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C18orf21Q32NC0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C18orf21Q32NC0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C18orf21Q32NC0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C18orf21Q32NC0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C18orf21Q32NC0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
C18orf21Q32NC0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
C18orf21Q32NC0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C18orf21Q32NC0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C18orf21Q32NC0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C18orf21Q32NC0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C18orf21Q32NC0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C18orf21Q32NC0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C18orf21Q32NC0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms