Protein–RNA interactions for Protein: Q06830

PRDX1, Peroxiredoxin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDX1Q06830 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRDX1Q06830 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRDX1Q06830 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRDX1Q06830 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRDX1Q06830 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRDX1Q06830 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRDX1Q06830 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRDX1Q06830 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRDX1Q06830 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRDX1Q06830 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRDX1Q06830 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRDX1Q06830 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRDX1Q06830 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRDX1Q06830 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRDX1Q06830 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRDX1Q06830 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRDX1Q06830 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRDX1Q06830 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRDX1Q06830 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRDX1Q06830 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRDX1Q06830 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRDX1Q06830 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRDX1Q06830 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRDX1Q06830 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRDX1Q06830 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRDX1Q06830 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRDX1Q06830 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRDX1Q06830 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRDX1Q06830 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRDX1Q06830 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRDX1Q06830 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRDX1Q06830 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRDX1Q06830 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRDX1Q06830 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRDX1Q06830 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRDX1Q06830 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRDX1Q06830 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRDX1Q06830 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PRDX1Q06830 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRDX1Q06830 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PRDX1Q06830 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRDX1Q06830 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PRDX1Q06830 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRDX1Q06830 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PRDX1Q06830 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRDX1Q06830 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRDX1Q06830 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRDX1Q06830 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRDX1Q06830 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRDX1Q06830 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRDX1Q06830 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRDX1Q06830 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRDX1Q06830 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRDX1Q06830 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRDX1Q06830 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRDX1Q06830 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRDX1Q06830 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PRDX1Q06830 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRDX1Q06830 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRDX1Q06830 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRDX1Q06830 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRDX1Q06830 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRDX1Q06830 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRDX1Q06830 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRDX1Q06830 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PRDX1Q06830 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRDX1Q06830 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRDX1Q06830 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRDX1Q06830 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PRDX1Q06830 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRDX1Q06830 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRDX1Q06830 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRDX1Q06830 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRDX1Q06830 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRDX1Q06830 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRDX1Q06830 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRDX1Q06830 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PRDX1Q06830 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRDX1Q06830 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRDX1Q06830 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRDX1Q06830 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRDX1Q06830 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRDX1Q06830 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRDX1Q06830 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRDX1Q06830 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRDX1Q06830 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRDX1Q06830 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PRDX1Q06830 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRDX1Q06830 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRDX1Q06830 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRDX1Q06830 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PRDX1Q06830 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRDX1Q06830 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRDX1Q06830 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRDX1Q06830 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRDX1Q06830 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRDX1Q06830 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRDX1Q06830 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRDX1Q06830 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRDX1Q06830 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms