Protein–RNA interactions for Protein: P61586

RHOA, Transforming protein RhoA, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOAP61586 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RHOAP61586 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RHOAP61586 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RHOAP61586 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RHOAP61586 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RHOAP61586 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RHOAP61586 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RHOAP61586 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RHOAP61586 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RHOAP61586 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RHOAP61586 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RHOAP61586 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RHOAP61586 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RHOAP61586 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RHOAP61586 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RHOAP61586 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RHOAP61586 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RHOAP61586 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RHOAP61586 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RHOAP61586 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RHOAP61586 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RHOAP61586 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RHOAP61586 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
RHOAP61586 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RHOAP61586 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RHOAP61586 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RHOAP61586 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RHOAP61586 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RHOAP61586 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RHOAP61586 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RHOAP61586 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RHOAP61586 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RHOAP61586 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RHOAP61586 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RHOAP61586 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RHOAP61586 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RHOAP61586 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RHOAP61586 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RHOAP61586 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RHOAP61586 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RHOAP61586 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RHOAP61586 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RHOAP61586 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RHOAP61586 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RHOAP61586 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RHOAP61586 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RHOAP61586 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RHOAP61586 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RHOAP61586 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RHOAP61586 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RHOAP61586 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RHOAP61586 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RHOAP61586 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RHOAP61586 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RHOAP61586 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RHOAP61586 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RHOAP61586 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RHOAP61586 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RHOAP61586 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RHOAP61586 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RHOAP61586 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RHOAP61586 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RHOAP61586 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RHOAP61586 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RHOAP61586 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RHOAP61586 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RHOAP61586 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RHOAP61586 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RHOAP61586 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RHOAP61586 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RHOAP61586 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RHOAP61586 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RHOAP61586 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RHOAP61586 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RHOAP61586 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RHOAP61586 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RHOAP61586 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RHOAP61586 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RHOAP61586 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RHOAP61586 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RHOAP61586 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RHOAP61586 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RHOAP61586 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RHOAP61586 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RHOAP61586 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RHOAP61586 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RHOAP61586 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RHOAP61586 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RHOAP61586 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RHOAP61586 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RHOAP61586 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RHOAP61586 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RHOAP61586 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RHOAP61586 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RHOAP61586 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RHOAP61586 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RHOAP61586 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RHOAP61586 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RHOAP61586 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RHOAP61586 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms