Protein–RNA interactions for Protein: P47972

NPTX2, Neuronal pentraxin-2, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX2P47972 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NPTX2P47972 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NPTX2P47972 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NPTX2P47972 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NPTX2P47972 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NPTX2P47972 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NPTX2P47972 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NPTX2P47972 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NPTX2P47972 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NPTX2P47972 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NPTX2P47972 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NPTX2P47972 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NPTX2P47972 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NPTX2P47972 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NPTX2P47972 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NPTX2P47972 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NPTX2P47972 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NPTX2P47972 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NPTX2P47972 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NPTX2P47972 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NPTX2P47972 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NPTX2P47972 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NPTX2P47972 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NPTX2P47972 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NPTX2P47972 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.57■■■□□ 2
NPTX2P47972 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.55■■■□□ 2
NPTX2P47972 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NPTX2P47972 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NPTX2P47972 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NPTX2P47972 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NPTX2P47972 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NPTX2P47972 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NPTX2P47972 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NPTX2P47972 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NPTX2P47972 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NPTX2P47972 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NPTX2P47972 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NPTX2P47972 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NPTX2P47972 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NPTX2P47972 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
NPTX2P47972 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NPTX2P47972 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NPTX2P47972 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NPTX2P47972 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NPTX2P47972 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NPTX2P47972 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NPTX2P47972 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NPTX2P47972 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NPTX2P47972 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NPTX2P47972 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NPTX2P47972 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
NPTX2P47972 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NPTX2P47972 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
NPTX2P47972 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NPTX2P47972 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NPTX2P47972 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
NPTX2P47972 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
NPTX2P47972 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NPTX2P47972 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NPTX2P47972 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NPTX2P47972 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NPTX2P47972 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NPTX2P47972 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
NPTX2P47972 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NPTX2P47972 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NPTX2P47972 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NPTX2P47972 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NPTX2P47972 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NPTX2P47972 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NPTX2P47972 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
NPTX2P47972 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NPTX2P47972 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NPTX2P47972 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NPTX2P47972 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NPTX2P47972 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NPTX2P47972 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NPTX2P47972 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NPTX2P47972 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NPTX2P47972 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NPTX2P47972 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NPTX2P47972 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
NPTX2P47972 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NPTX2P47972 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NPTX2P47972 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NPTX2P47972 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NPTX2P47972 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NPTX2P47972 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NPTX2P47972 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NPTX2P47972 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NPTX2P47972 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NPTX2P47972 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NPTX2P47972 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NPTX2P47972 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NPTX2P47972 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NPTX2P47972 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NPTX2P47972 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
NPTX2P47972 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NPTX2P47972 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NPTX2P47972 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NPTX2P47972 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.8 ms