Protein–RNA interactions for Protein: P11509

CYP2A6, Cytochrome P450 2A6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2A6P11509 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CYP2A6P11509 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CYP2A6P11509 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CYP2A6P11509 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CYP2A6P11509 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CYP2A6P11509 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CYP2A6P11509 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CYP2A6P11509 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CYP2A6P11509 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CYP2A6P11509 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CYP2A6P11509 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CYP2A6P11509 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CYP2A6P11509 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CYP2A6P11509 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CYP2A6P11509 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CYP2A6P11509 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CYP2A6P11509 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CYP2A6P11509 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CYP2A6P11509 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CYP2A6P11509 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CYP2A6P11509 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CYP2A6P11509 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CYP2A6P11509 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CYP2A6P11509 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CYP2A6P11509 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CYP2A6P11509 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CYP2A6P11509 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CYP2A6P11509 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CYP2A6P11509 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CYP2A6P11509 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CYP2A6P11509 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CYP2A6P11509 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CYP2A6P11509 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CYP2A6P11509 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYP2A6P11509 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYP2A6P11509 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYP2A6P11509 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CYP2A6P11509 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYP2A6P11509 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CYP2A6P11509 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CYP2A6P11509 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CYP2A6P11509 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CYP2A6P11509 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CYP2A6P11509 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CYP2A6P11509 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CYP2A6P11509 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CYP2A6P11509 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CYP2A6P11509 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CYP2A6P11509 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CYP2A6P11509 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CYP2A6P11509 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CYP2A6P11509 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CYP2A6P11509 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CYP2A6P11509 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CYP2A6P11509 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CYP2A6P11509 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CYP2A6P11509 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CYP2A6P11509 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CYP2A6P11509 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CYP2A6P11509 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CYP2A6P11509 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CYP2A6P11509 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CYP2A6P11509 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CYP2A6P11509 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CYP2A6P11509 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CYP2A6P11509 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CYP2A6P11509 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CYP2A6P11509 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CYP2A6P11509 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CYP2A6P11509 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CYP2A6P11509 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CYP2A6P11509 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CYP2A6P11509 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CYP2A6P11509 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CYP2A6P11509 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CYP2A6P11509 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CYP2A6P11509 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CYP2A6P11509 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CYP2A6P11509 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CYP2A6P11509 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CYP2A6P11509 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CYP2A6P11509 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CYP2A6P11509 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CYP2A6P11509 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CYP2A6P11509 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CYP2A6P11509 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CYP2A6P11509 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CYP2A6P11509 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CYP2A6P11509 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CYP2A6P11509 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CYP2A6P11509 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CYP2A6P11509 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CYP2A6P11509 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CYP2A6P11509 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CYP2A6P11509 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CYP2A6P11509 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CYP2A6P11509 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CYP2A6P11509 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CYP2A6P11509 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CYP2A6P11509 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms