Protein–RNA interactions for Protein: P09326

CD48, CD48 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD48P09326 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CD48P09326 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CD48P09326 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CD48P09326 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CD48P09326 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CD48P09326 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CD48P09326 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CD48P09326 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CD48P09326 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CD48P09326 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CD48P09326 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CD48P09326 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CD48P09326 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CD48P09326 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CD48P09326 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CD48P09326 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CD48P09326 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CD48P09326 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CD48P09326 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CD48P09326 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CD48P09326 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CD48P09326 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CD48P09326 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
CD48P09326 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CD48P09326 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CD48P09326 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CD48P09326 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CD48P09326 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CD48P09326 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CD48P09326 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CD48P09326 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CD48P09326 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CD48P09326 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CD48P09326 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CD48P09326 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CD48P09326 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CD48P09326 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CD48P09326 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CD48P09326 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CD48P09326 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CD48P09326 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CD48P09326 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CD48P09326 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CD48P09326 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CD48P09326 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CD48P09326 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CD48P09326 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CD48P09326 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CD48P09326 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CD48P09326 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CD48P09326 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CD48P09326 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CD48P09326 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CD48P09326 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CD48P09326 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CD48P09326 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CD48P09326 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CD48P09326 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CD48P09326 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CD48P09326 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CD48P09326 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CD48P09326 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CD48P09326 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CD48P09326 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CD48P09326 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CD48P09326 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CD48P09326 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CD48P09326 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CD48P09326 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CD48P09326 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CD48P09326 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CD48P09326 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CD48P09326 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CD48P09326 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CD48P09326 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CD48P09326 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CD48P09326 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CD48P09326 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CD48P09326 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CD48P09326 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CD48P09326 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CD48P09326 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CD48P09326 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CD48P09326 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CD48P09326 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CD48P09326 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CD48P09326 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CD48P09326 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CD48P09326 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CD48P09326 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CD48P09326 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CD48P09326 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CD48P09326 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CD48P09326 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CD48P09326 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CD48P09326 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CD48P09326 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CD48P09326 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CD48P09326 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CD48P09326 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms