Protein–RNA interactions for Protein: O94779

CNTN5, Contactin-5, humanhuman

Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN5O94779 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNTN5O94779 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CNTN5O94779 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNTN5O94779 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNTN5O94779 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNTN5O94779 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNTN5O94779 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNTN5O94779 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNTN5O94779 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNTN5O94779 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNTN5O94779 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNTN5O94779 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNTN5O94779 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNTN5O94779 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNTN5O94779 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CNTN5O94779 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNTN5O94779 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNTN5O94779 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNTN5O94779 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNTN5O94779 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNTN5O94779 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNTN5O94779 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNTN5O94779 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNTN5O94779 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNTN5O94779 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNTN5O94779 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNTN5O94779 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNTN5O94779 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CNTN5O94779 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNTN5O94779 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNTN5O94779 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNTN5O94779 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNTN5O94779 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNTN5O94779 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CNTN5O94779 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNTN5O94779 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNTN5O94779 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNTN5O94779 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNTN5O94779 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNTN5O94779 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNTN5O94779 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNTN5O94779 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNTN5O94779 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNTN5O94779 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNTN5O94779 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNTN5O94779 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNTN5O94779 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNTN5O94779 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNTN5O94779 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CNTN5O94779 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNTN5O94779 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CNTN5O94779 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNTN5O94779 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CNTN5O94779 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNTN5O94779 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNTN5O94779 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNTN5O94779 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNTN5O94779 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CNTN5O94779 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNTN5O94779 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNTN5O94779 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CNTN5O94779 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CNTN5O94779 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNTN5O94779 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNTN5O94779 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNTN5O94779 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNTN5O94779 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CNTN5O94779 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNTN5O94779 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNTN5O94779 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNTN5O94779 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNTN5O94779 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNTN5O94779 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNTN5O94779 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNTN5O94779 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNTN5O94779 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNTN5O94779 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNTN5O94779 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNTN5O94779 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNTN5O94779 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNTN5O94779 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNTN5O94779 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CNTN5O94779 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNTN5O94779 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CNTN5O94779 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNTN5O94779 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNTN5O94779 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CNTN5O94779 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTN5O94779 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTN5O94779 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTN5O94779 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTN5O94779 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTN5O94779 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNTN5O94779 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNTN5O94779 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNTN5O94779 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNTN5O94779 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNTN5O94779 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNTN5O94779 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNTN5O94779 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms