Protein–RNA interactions for Protein: O43292

GPAA1, Glycosylphosphatidylinositol anchor attachment 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAA1O43292 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
GPAA1O43292 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
GPAA1O43292 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
GPAA1O43292 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
GPAA1O43292 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
GPAA1O43292 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
GPAA1O43292 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
GPAA1O43292 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
GPAA1O43292 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
GPAA1O43292 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
GPAA1O43292 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
GPAA1O43292 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
GPAA1O43292 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
GPAA1O43292 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
GPAA1O43292 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
GPAA1O43292 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
GPAA1O43292 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
GPAA1O43292 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
GPAA1O43292 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
GPAA1O43292 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
GPAA1O43292 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
GPAA1O43292 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
GPAA1O43292 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC30■■■□□ 2.39
GPAA1O43292 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
GPAA1O43292 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
GPAA1O43292 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
GPAA1O43292 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
GPAA1O43292 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
GPAA1O43292 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
GPAA1O43292 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
GPAA1O43292 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
GPAA1O43292 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
GPAA1O43292 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
GPAA1O43292 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
GPAA1O43292 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
GPAA1O43292 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
GPAA1O43292 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
GPAA1O43292 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
GPAA1O43292 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
GPAA1O43292 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
GPAA1O43292 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
GPAA1O43292 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
GPAA1O43292 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
GPAA1O43292 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
GPAA1O43292 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
GPAA1O43292 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
GPAA1O43292 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
GPAA1O43292 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
GPAA1O43292 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
GPAA1O43292 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
GPAA1O43292 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
GPAA1O43292 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
GPAA1O43292 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
GPAA1O43292 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
GPAA1O43292 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
GPAA1O43292 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
GPAA1O43292 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
GPAA1O43292 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
GPAA1O43292 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
GPAA1O43292 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
GPAA1O43292 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
GPAA1O43292 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
GPAA1O43292 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
GPAA1O43292 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
GPAA1O43292 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
GPAA1O43292 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
GPAA1O43292 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
GPAA1O43292 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
GPAA1O43292 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
GPAA1O43292 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
GPAA1O43292 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
GPAA1O43292 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
GPAA1O43292 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
GPAA1O43292 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
GPAA1O43292 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
GPAA1O43292 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
GPAA1O43292 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
GPAA1O43292 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
GPAA1O43292 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
GPAA1O43292 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
GPAA1O43292 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
GPAA1O43292 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
GPAA1O43292 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
GPAA1O43292 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
GPAA1O43292 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
GPAA1O43292 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
GPAA1O43292 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
GPAA1O43292 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
GPAA1O43292 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
GPAA1O43292 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
GPAA1O43292 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
GPAA1O43292 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
GPAA1O43292 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
GPAA1O43292 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
GPAA1O43292 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
GPAA1O43292 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
GPAA1O43292 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
GPAA1O43292 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
GPAA1O43292 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
GPAA1O43292 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.5 ms