Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q06

PLIN4, Perilipin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN4Q96Q06 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PLIN4Q96Q06 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
PLIN4Q96Q06 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
PLIN4Q96Q06 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PLIN4Q96Q06 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PLIN4Q96Q06 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PLIN4Q96Q06 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PLIN4Q96Q06 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PLIN4Q96Q06 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PLIN4Q96Q06 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PLIN4Q96Q06 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PLIN4Q96Q06 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
PLIN4Q96Q06 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
PLIN4Q96Q06 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
PLIN4Q96Q06 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PLIN4Q96Q06 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PLIN4Q96Q06 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PLIN4Q96Q06 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PLIN4Q96Q06 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
PLIN4Q96Q06 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PLIN4Q96Q06 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PLIN4Q96Q06 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PLIN4Q96Q06 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PLIN4Q96Q06 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PLIN4Q96Q06 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PLIN4Q96Q06 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PLIN4Q96Q06 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PLIN4Q96Q06 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PLIN4Q96Q06 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PLIN4Q96Q06 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PLIN4Q96Q06 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PLIN4Q96Q06 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PLIN4Q96Q06 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PLIN4Q96Q06 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PLIN4Q96Q06 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PLIN4Q96Q06 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PLIN4Q96Q06 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PLIN4Q96Q06 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PLIN4Q96Q06 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
PLIN4Q96Q06 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PLIN4Q96Q06 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PLIN4Q96Q06 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PLIN4Q96Q06 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PLIN4Q96Q06 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
PLIN4Q96Q06 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PLIN4Q96Q06 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PLIN4Q96Q06 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PLIN4Q96Q06 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
PLIN4Q96Q06 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
PLIN4Q96Q06 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PLIN4Q96Q06 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PLIN4Q96Q06 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PLIN4Q96Q06 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PLIN4Q96Q06 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PLIN4Q96Q06 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PLIN4Q96Q06 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PLIN4Q96Q06 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PLIN4Q96Q06 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PLIN4Q96Q06 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PLIN4Q96Q06 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PLIN4Q96Q06 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
PLIN4Q96Q06 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
PLIN4Q96Q06 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
PLIN4Q96Q06 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PLIN4Q96Q06 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PLIN4Q96Q06 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
PLIN4Q96Q06 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PLIN4Q96Q06 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PLIN4Q96Q06 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PLIN4Q96Q06 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PLIN4Q96Q06 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PLIN4Q96Q06 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PLIN4Q96Q06 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PLIN4Q96Q06 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PLIN4Q96Q06 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PLIN4Q96Q06 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
PLIN4Q96Q06 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PLIN4Q96Q06 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PLIN4Q96Q06 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PLIN4Q96Q06 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PLIN4Q96Q06 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PLIN4Q96Q06 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PLIN4Q96Q06 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PLIN4Q96Q06 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
PLIN4Q96Q06 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
PLIN4Q96Q06 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PLIN4Q96Q06 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PLIN4Q96Q06 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PLIN4Q96Q06 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PLIN4Q96Q06 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PLIN4Q96Q06 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PLIN4Q96Q06 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PLIN4Q96Q06 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PLIN4Q96Q06 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PLIN4Q96Q06 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
PLIN4Q96Q06 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PLIN4Q96Q06 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PLIN4Q96Q06 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PLIN4Q96Q06 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PLIN4Q96Q06 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms