Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
CASP7P55210 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
CASP7P55210 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
CASP7P55210 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CASP7P55210 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
CASP7P55210 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CASP7P55210 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CASP7P55210 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CASP7P55210 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
CASP7P55210 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
CASP7P55210 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC31.65■■■□□ 2.66
CASP7P55210 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CASP7P55210 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
CASP7P55210 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
CASP7P55210 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
CASP7P55210 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CASP7P55210 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CASP7P55210 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CASP7P55210 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
CASP7P55210 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CASP7P55210 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
CASP7P55210 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
CASP7P55210 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CASP7P55210 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CASP7P55210 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CASP7P55210 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CASP7P55210 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
CASP7P55210 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC31.61■■■□□ 2.65
CASP7P55210 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CASP7P55210 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CASP7P55210 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CASP7P55210 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CASP7P55210 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CASP7P55210 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CASP7P55210 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CASP7P55210 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CASP7P55210 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CASP7P55210 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CASP7P55210 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CASP7P55210 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CASP7P55210 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CASP7P55210 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CASP7P55210 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CASP7P55210 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CASP7P55210 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CASP7P55210 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CASP7P55210 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CASP7P55210 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CASP7P55210 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CASP7P55210 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
CASP7P55210 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CASP7P55210 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CASP7P55210 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CASP7P55210 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CASP7P55210 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CASP7P55210 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CASP7P55210 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
CASP7P55210 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
CASP7P55210 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.64
CASP7P55210 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
CASP7P55210 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
CASP7P55210 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
CASP7P55210 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CASP7P55210 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CASP7P55210 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CASP7P55210 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CASP7P55210 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CASP7P55210 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CASP7P55210 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CASP7P55210 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CASP7P55210 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CASP7P55210 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CASP7P55210 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
CASP7P55210 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CASP7P55210 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CASP7P55210 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CASP7P55210 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
CASP7P55210 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CASP7P55210 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CASP7P55210 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CASP7P55210 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
CASP7P55210 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
CASP7P55210 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
CASP7P55210 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
CASP7P55210 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
CASP7P55210 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.62
CASP7P55210 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CASP7P55210 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CASP7P55210 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
CASP7P55210 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
CASP7P55210 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
CASP7P55210 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
CASP7P55210 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CASP7P55210 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CASP7P55210 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
CASP7P55210 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CASP7P55210 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
CASP7P55210 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
CASP7P55210 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CASP7P55210 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms