Protein–RNA interactions for Protein: P51790

CLCN3, H(+)/Cl(-) exchange transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN3P51790 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLCN3P51790 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLCN3P51790 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLCN3P51790 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLCN3P51790 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLCN3P51790 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLCN3P51790 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLCN3P51790 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLCN3P51790 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLCN3P51790 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLCN3P51790 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLCN3P51790 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CLCN3P51790 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CLCN3P51790 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CLCN3P51790 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CLCN3P51790 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLCN3P51790 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLCN3P51790 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLCN3P51790 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLCN3P51790 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLCN3P51790 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLCN3P51790 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CLCN3P51790 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CLCN3P51790 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CLCN3P51790 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CLCN3P51790 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CLCN3P51790 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CLCN3P51790 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CLCN3P51790 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLCN3P51790 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLCN3P51790 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLCN3P51790 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLCN3P51790 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLCN3P51790 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLCN3P51790 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLCN3P51790 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLCN3P51790 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLCN3P51790 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLCN3P51790 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLCN3P51790 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLCN3P51790 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLCN3P51790 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLCN3P51790 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLCN3P51790 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CLCN3P51790 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CLCN3P51790 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CLCN3P51790 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.04
CLCN3P51790 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.83■■■□□ 2.04
CLCN3P51790 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CLCN3P51790 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLCN3P51790 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CLCN3P51790 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CLCN3P51790 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CLCN3P51790 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CLCN3P51790 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CLCN3P51790 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CLCN3P51790 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CLCN3P51790 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CLCN3P51790 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CLCN3P51790 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CLCN3P51790 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CLCN3P51790 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CLCN3P51790 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CLCN3P51790 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CLCN3P51790 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CLCN3P51790 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CLCN3P51790 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CLCN3P51790 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CLCN3P51790 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CLCN3P51790 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CLCN3P51790 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CLCN3P51790 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CLCN3P51790 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CLCN3P51790 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CLCN3P51790 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CLCN3P51790 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CLCN3P51790 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CLCN3P51790 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CLCN3P51790 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CLCN3P51790 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CLCN3P51790 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CLCN3P51790 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CLCN3P51790 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CLCN3P51790 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CLCN3P51790 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CLCN3P51790 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CLCN3P51790 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CLCN3P51790 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CLCN3P51790 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CLCN3P51790 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CLCN3P51790 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CLCN3P51790 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CLCN3P51790 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CLCN3P51790 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CLCN3P51790 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CLCN3P51790 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CLCN3P51790 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CLCN3P51790 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CLCN3P51790 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CLCN3P51790 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms