Protein–RNA interactions for Protein: P23760

PAX3, Paired box protein Pax-3, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX3P23760 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PAX3P23760 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PAX3P23760 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PAX3P23760 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PAX3P23760 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PAX3P23760 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PAX3P23760 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PAX3P23760 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PAX3P23760 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PAX3P23760 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PAX3P23760 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PAX3P23760 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PAX3P23760 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PAX3P23760 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PAX3P23760 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PAX3P23760 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PAX3P23760 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PAX3P23760 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PAX3P23760 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PAX3P23760 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PAX3P23760 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PAX3P23760 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PAX3P23760 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PAX3P23760 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PAX3P23760 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PAX3P23760 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PAX3P23760 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PAX3P23760 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PAX3P23760 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PAX3P23760 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PAX3P23760 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PAX3P23760 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PAX3P23760 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
PAX3P23760 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PAX3P23760 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PAX3P23760 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PAX3P23760 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PAX3P23760 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PAX3P23760 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PAX3P23760 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PAX3P23760 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PAX3P23760 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PAX3P23760 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PAX3P23760 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PAX3P23760 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PAX3P23760 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PAX3P23760 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PAX3P23760 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PAX3P23760 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PAX3P23760 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PAX3P23760 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PAX3P23760 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PAX3P23760 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PAX3P23760 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PAX3P23760 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PAX3P23760 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PAX3P23760 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PAX3P23760 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PAX3P23760 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PAX3P23760 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PAX3P23760 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PAX3P23760 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PAX3P23760 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PAX3P23760 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PAX3P23760 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PAX3P23760 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PAX3P23760 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PAX3P23760 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PAX3P23760 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PAX3P23760 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PAX3P23760 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PAX3P23760 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PAX3P23760 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PAX3P23760 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PAX3P23760 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PAX3P23760 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PAX3P23760 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PAX3P23760 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PAX3P23760 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PAX3P23760 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PAX3P23760 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
PAX3P23760 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PAX3P23760 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PAX3P23760 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PAX3P23760 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PAX3P23760 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PAX3P23760 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PAX3P23760 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PAX3P23760 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PAX3P23760 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PAX3P23760 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PAX3P23760 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PAX3P23760 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PAX3P23760 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PAX3P23760 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PAX3P23760 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PAX3P23760 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PAX3P23760 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PAX3P23760 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PAX3P23760 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms