Protein–RNA interactions for Protein: P23760

PAX3, Paired box protein Pax-3, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX3P23760 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC36.89■■■■□ 3.5
PAX3P23760 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
PAX3P23760 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC35.89■■■■□ 3.34
PAX3P23760 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
PAX3P23760 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
PAX3P23760 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
PAX3P23760 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
PAX3P23760 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.19■■■■□ 3.22
PAX3P23760 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
PAX3P23760 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
PAX3P23760 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
PAX3P23760 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
PAX3P23760 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
PAX3P23760 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
PAX3P23760 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
PAX3P23760 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
PAX3P23760 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
PAX3P23760 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
PAX3P23760 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PAX3P23760 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PAX3P23760 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
PAX3P23760 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
PAX3P23760 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
PAX3P23760 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PAX3P23760 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
PAX3P23760 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
PAX3P23760 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PAX3P23760 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PAX3P23760 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
PAX3P23760 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PAX3P23760 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
PAX3P23760 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
PAX3P23760 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PAX3P23760 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
PAX3P23760 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
PAX3P23760 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
PAX3P23760 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
PAX3P23760 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
PAX3P23760 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
PAX3P23760 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
PAX3P23760 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
PAX3P23760 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
PAX3P23760 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
PAX3P23760 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
PAX3P23760 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
PAX3P23760 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
PAX3P23760 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
PAX3P23760 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
PAX3P23760 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
PAX3P23760 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
PAX3P23760 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
PAX3P23760 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
PAX3P23760 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
PAX3P23760 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
PAX3P23760 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
PAX3P23760 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
PAX3P23760 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PAX3P23760 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
PAX3P23760 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
PAX3P23760 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
PAX3P23760 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
PAX3P23760 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
PAX3P23760 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
PAX3P23760 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.77■■■□□ 2.68
PAX3P23760 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
PAX3P23760 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
PAX3P23760 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PAX3P23760 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PAX3P23760 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.61■■■□□ 2.65
PAX3P23760 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
PAX3P23760 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PAX3P23760 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PAX3P23760 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
PAX3P23760 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PAX3P23760 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PAX3P23760 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
PAX3P23760 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
PAX3P23760 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PAX3P23760 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PAX3P23760 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
PAX3P23760 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
PAX3P23760 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PAX3P23760 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PAX3P23760 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
PAX3P23760 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
PAX3P23760 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
PAX3P23760 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PAX3P23760 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PAX3P23760 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PAX3P23760 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
PAX3P23760 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
PAX3P23760 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
PAX3P23760 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PAX3P23760 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PAX3P23760 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
PAX3P23760 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PAX3P23760 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PAX3P23760 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
PAX3P23760 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PAX3P23760 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms