Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1K6

TLNRD1, Talin rod domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLNRD1Q9H1K6 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TLNRD1Q9H1K6 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TLNRD1Q9H1K6 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
TLNRD1Q9H1K6 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TLNRD1Q9H1K6 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TLNRD1Q9H1K6 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TLNRD1Q9H1K6 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TLNRD1Q9H1K6 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TLNRD1Q9H1K6 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TLNRD1Q9H1K6 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TLNRD1Q9H1K6 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
TLNRD1Q9H1K6 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TLNRD1Q9H1K6 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TLNRD1Q9H1K6 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TLNRD1Q9H1K6 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TLNRD1Q9H1K6 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TLNRD1Q9H1K6 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TLNRD1Q9H1K6 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TLNRD1Q9H1K6 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TLNRD1Q9H1K6 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TLNRD1Q9H1K6 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TLNRD1Q9H1K6 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TLNRD1Q9H1K6 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TLNRD1Q9H1K6 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TLNRD1Q9H1K6 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TLNRD1Q9H1K6 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TLNRD1Q9H1K6 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TLNRD1Q9H1K6 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TLNRD1Q9H1K6 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TLNRD1Q9H1K6 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TLNRD1Q9H1K6 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TLNRD1Q9H1K6 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TLNRD1Q9H1K6 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TLNRD1Q9H1K6 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TLNRD1Q9H1K6 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TLNRD1Q9H1K6 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TLNRD1Q9H1K6 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TLNRD1Q9H1K6 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TLNRD1Q9H1K6 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TLNRD1Q9H1K6 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TLNRD1Q9H1K6 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TLNRD1Q9H1K6 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TLNRD1Q9H1K6 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TLNRD1Q9H1K6 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TLNRD1Q9H1K6 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TLNRD1Q9H1K6 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TLNRD1Q9H1K6 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TLNRD1Q9H1K6 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TLNRD1Q9H1K6 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TLNRD1Q9H1K6 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TLNRD1Q9H1K6 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TLNRD1Q9H1K6 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TLNRD1Q9H1K6 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TLNRD1Q9H1K6 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TLNRD1Q9H1K6 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TLNRD1Q9H1K6 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TLNRD1Q9H1K6 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TLNRD1Q9H1K6 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TLNRD1Q9H1K6 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TLNRD1Q9H1K6 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TLNRD1Q9H1K6 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TLNRD1Q9H1K6 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TLNRD1Q9H1K6 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TLNRD1Q9H1K6 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TLNRD1Q9H1K6 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TLNRD1Q9H1K6 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TLNRD1Q9H1K6 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TLNRD1Q9H1K6 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TLNRD1Q9H1K6 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TLNRD1Q9H1K6 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TLNRD1Q9H1K6 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TLNRD1Q9H1K6 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TLNRD1Q9H1K6 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TLNRD1Q9H1K6 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TLNRD1Q9H1K6 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TLNRD1Q9H1K6 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TLNRD1Q9H1K6 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TLNRD1Q9H1K6 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TLNRD1Q9H1K6 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TLNRD1Q9H1K6 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TLNRD1Q9H1K6 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TLNRD1Q9H1K6 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TLNRD1Q9H1K6 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TLNRD1Q9H1K6 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TLNRD1Q9H1K6 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TLNRD1Q9H1K6 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TLNRD1Q9H1K6 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TLNRD1Q9H1K6 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TLNRD1Q9H1K6 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TLNRD1Q9H1K6 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TLNRD1Q9H1K6 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TLNRD1Q9H1K6 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TLNRD1Q9H1K6 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TLNRD1Q9H1K6 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TLNRD1Q9H1K6 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TLNRD1Q9H1K6 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TLNRD1Q9H1K6 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TLNRD1Q9H1K6 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TLNRD1Q9H1K6 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TLNRD1Q9H1K6 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms