Protein–RNA interactions for Protein: Q99856

ARID3A, AT-rich interactive domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3AQ99856 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
ARID3AQ99856 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC37.56■■■■□ 3.6
ARID3AQ99856 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC36.62■■■■□ 3.45
ARID3AQ99856 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC36.51■■■■□ 3.43
ARID3AQ99856 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
ARID3AQ99856 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
ARID3AQ99856 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
ARID3AQ99856 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
ARID3AQ99856 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
ARID3AQ99856 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
ARID3AQ99856 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
ARID3AQ99856 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
ARID3AQ99856 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
ARID3AQ99856 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
ARID3AQ99856 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
ARID3AQ99856 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
ARID3AQ99856 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC34.94■■■■□ 3.18
ARID3AQ99856 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
ARID3AQ99856 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
ARID3AQ99856 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
ARID3AQ99856 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
ARID3AQ99856 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
ARID3AQ99856 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
ARID3AQ99856 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
ARID3AQ99856 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
ARID3AQ99856 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
ARID3AQ99856 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
ARID3AQ99856 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
ARID3AQ99856 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
ARID3AQ99856 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
ARID3AQ99856 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
ARID3AQ99856 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
ARID3AQ99856 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
ARID3AQ99856 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
ARID3AQ99856 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
ARID3AQ99856 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
ARID3AQ99856 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
ARID3AQ99856 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
ARID3AQ99856 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
ARID3AQ99856 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
ARID3AQ99856 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
ARID3AQ99856 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
ARID3AQ99856 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
ARID3AQ99856 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ARID3AQ99856 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
ARID3AQ99856 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
ARID3AQ99856 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
ARID3AQ99856 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
ARID3AQ99856 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
ARID3AQ99856 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
ARID3AQ99856 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC32.94■■■□□ 2.86
ARID3AQ99856 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
ARID3AQ99856 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
ARID3AQ99856 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
ARID3AQ99856 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
ARID3AQ99856 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
ARID3AQ99856 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
ARID3AQ99856 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
ARID3AQ99856 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
ARID3AQ99856 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
ARID3AQ99856 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
ARID3AQ99856 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
ARID3AQ99856 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
ARID3AQ99856 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
ARID3AQ99856 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
ARID3AQ99856 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
ARID3AQ99856 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
ARID3AQ99856 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
ARID3AQ99856 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
ARID3AQ99856 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
ARID3AQ99856 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
ARID3AQ99856 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
ARID3AQ99856 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
ARID3AQ99856 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
ARID3AQ99856 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
ARID3AQ99856 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
ARID3AQ99856 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
ARID3AQ99856 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
ARID3AQ99856 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
ARID3AQ99856 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
ARID3AQ99856 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
ARID3AQ99856 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
ARID3AQ99856 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
ARID3AQ99856 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
ARID3AQ99856 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
ARID3AQ99856 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
ARID3AQ99856 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
ARID3AQ99856 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC32.35■■■□□ 2.77
ARID3AQ99856 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC32.35■■■□□ 2.77
ARID3AQ99856 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
ARID3AQ99856 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
ARID3AQ99856 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
ARID3AQ99856 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
ARID3AQ99856 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
ARID3AQ99856 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
ARID3AQ99856 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
ARID3AQ99856 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
ARID3AQ99856 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ARID3AQ99856 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC32■■■□□ 2.71
ARID3AQ99856 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms