Protein–RNA interactions for Protein: Q96I24

FUBP3, Far upstream element-binding protein 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FUBP3Q96I24 FABP1-201ENST00000295834 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.964e-25■■■■■ 107.2
FUBP3Q96I24 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.244e-19■■■■■ 92.3
FUBP3Q96I24 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.035e-25■■■■■ 86.6
FUBP3Q96I24 FABP1-204ENST00000495375 2084 ntTSL 314.56□□□□□ -0.085e-25■■■■■ 86.6
FUBP3Q96I24 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.136e-11■■■■■ 81.8
FUBP3Q96I24 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.094e-14■■■■■ 78.9
FUBP3Q96I24 NCOA6-201ENST00000359003 7081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.684e-14■■■■■ 78.9
FUBP3Q96I24 NCOA6-209ENST00000628752 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 58.38□□□□□ -1.074e-14■■■■■ 78.9
FUBP3Q96I24 NCOA6-202ENST00000374796 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.364e-14■■■■■ 78.9
FUBP3Q96I24 NCOA6-205ENST00000593786 827 ntTSL 56.51□□□□□ -1.374e-14■■■■■ 78.9
FUBP3Q96I24 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.961e-22■■■■■ 76.1
FUBP3Q96I24 ERBB3-201ENST00000267101 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.624e-13■■■■■ 75
FUBP3Q96I24 ERBB3-213ENST00000549832 3289 ntTSL 2 BASIC8.15□□□□□ -1.14e-13■■■■■ 75
FUBP3Q96I24 AC034102.2-201ENST00000548861 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.554e-13■■■■■ 75
FUBP3Q96I24 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.018e-11■■■■■ 71.9
FUBP3Q96I24 SORL1-205ENST00000527649 1765 ntTSL 214.27□□□□□ -0.133e-6■■■■■ 68.4
FUBP3Q96I24 SORL1-206ENST00000527934 3032 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.633e-6■■■■■ 68.4
FUBP3Q96I24 SORL1-211ENST00000532694 3692 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.953e-6■■■■■ 68.4
FUBP3Q96I24 SORL1-204ENST00000525532 3836 ntTSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.953e-6■■■■■ 68.4
FUBP3Q96I24 SORL1-212ENST00000534286 3501 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.143e-6■■■■■ 68.4
FUBP3Q96I24 AGAP1-212ENST00000614409 9932 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.759e-11■■■■■ 67.5
FUBP3Q96I24 AGAP1-207ENST00000428334 10090 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.869e-11■■■■■ 67.5
FUBP3Q96I24 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.042e-10■■■■■ 65.8
FUBP3Q96I24 SMG8-202ENST00000543872 3477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.52e-10■■■■■ 65.8
FUBP3Q96I24 SMG8-206ENST00000582469 1144 ntTSL 57.27□□□□□ -1.252e-10■■■■■ 65.8
FUBP3Q96I24 AC099850.2-201ENST00000577660 557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.42e-10■■■■■ 65.8
FUBP3Q96I24 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.052e-7■■■■■ 63.1
FUBP3Q96I24 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.652e-7■■■■■ 63.1
FUBP3Q96I24 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.622e-7■■■■■ 63.1
FUBP3Q96I24 ASGR1-207ENST00000574330 887 ntTSL 517.45■□□□□ 0.382e-7■■■■■ 63.1
FUBP3Q96I24 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.062e-7■■■■■ 63.1
FUBP3Q96I24 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.062e-7■■■■■ 63.1
FUBP3Q96I24 ASGR1-203ENST00000570576 627 ntTSL 513.8□□□□□ -0.22e-7■■■■■ 63.1
FUBP3Q96I24 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.343e-18■■■■■ 61.7
FUBP3Q96I24 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.483e-18■■■■■ 61.7
FUBP3Q96I24 NFKBIA-203ENST00000554001 1396 ntTSL 515.76■□□□□ 0.113e-18■■■■■ 61.7
FUBP3Q96I24 NFKBIA-208ENST00000557140 1400 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.343e-18■■■■■ 61.7
FUBP3Q96I24 RABGGTB-201ENST00000319942 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.722e-11■■■■■ 61.7
FUBP3Q96I24 RABGGTB-208ENST00000471759 2137 ntTSL 26.39□□□□□ -1.392e-11■■■■■ 61.7
FUBP3Q96I24 RABGGTB-203ENST00000459697 1177 ntTSL 25.01□□□□□ -1.612e-11■■■■■ 61.7
FUBP3Q96I24 RABGGTB-213ENST00000496055 3863 ntTSL 24.44□□□□□ -1.72e-11■■■■■ 61.7
FUBP3Q96I24 CCNG2-203ENST00000497512 2051 ntTSL 1 (best)27.34■■□□□ 1.973e-14■■■■■ 61.6
FUBP3Q96I24 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.293e-14■■■■■ 61.6
FUBP3Q96I24 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.331e-8■■■■■ 61.3
FUBP3Q96I24 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.331e-8■■■■■ 61.3
FUBP3Q96I24 TNS1-220ENST00000611415 6509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.541e-8■■■■■ 61.3
FUBP3Q96I24 TNS1-221ENST00000615025 6488 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.671e-8■■■■■ 61.3
FUBP3Q96I24 TNS1-217ENST00000490566 1652 ntTSL 210.65□□□□□ -0.71e-8■■■■■ 61.3
FUBP3Q96I24 TNS1-209ENST00000446688 4292 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.831e-8■■■■■ 61.3
FUBP3Q96I24 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.13e-12■■■■■ 57.9
FUBP3Q96I24 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.163e-12■■■■■ 57.9
FUBP3Q96I24 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.293e-12■■■■■ 57.9
FUBP3Q96I24 RAPGEF6-207ENST00000507093 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.342e-11■■■■■ 55.8
FUBP3Q96I24 RAPGEF6-211ENST00000512611 3683 ntTSL 1 (best)6.56□□□□□ -1.362e-11■■■■■ 55.8
FUBP3Q96I24 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.712e-11■■■■■ 55.8
FUBP3Q96I24 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.843e-14■■■■■ 55.7
FUBP3Q96I24 RAB2A-205ENST00000466595 866 ntTSL 312.6□□□□□ -0.393e-14■■■■■ 55.7
FUBP3Q96I24 RAB2A-209ENST00000530071 659 ntTSL 510.88□□□□□ -0.673e-14■■■■■ 55.7
FUBP3Q96I24 SCARB2-208ENST00000638372 4811 ntTSL 514.31□□□□□ -0.122e-22■■■■■ 55.4
FUBP3Q96I24 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.091e-23■■■■■ 55.1
FUBP3Q96I24 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.111e-23■■■■■ 55.1
FUBP3Q96I24 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.351e-23■■■■■ 55.1
FUBP3Q96I24 AL132671.2-201ENST00000467125 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.631e-23■■■■■ 55.1
FUBP3Q96I24 TNS1-201ENST00000171887 10331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -11e-8■■■■■ 55.1
FUBP3Q96I24 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.386e-36■■■■■ 54.8
FUBP3Q96I24 PVT1-203ENST00000513868 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.279e-9■■■■■ 53.3
FUBP3Q96I24 PVT1-214ENST00000522875 922 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.199e-9■■■■■ 53.3
FUBP3Q96I24 PVT1-217ENST00000523190 443 ntTSL 37.04□□□□□ -1.289e-9■■■■■ 53.3
FUBP3Q96I24 PVT1-211ENST00000521600 408 ntTSL 23.97□□□□□ -1.779e-9■■■■■ 53.3
FUBP3Q96I24 PVT1-202ENST00000512617 383 ntTSL 33.93□□□□□ -1.789e-9■■■■■ 53.3
FUBP3Q96I24 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.469e-9■■■■■ 53.2
FUBP3Q96I24 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.429e-9■■■■■ 53.2
FUBP3Q96I24 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.33e-32■■■■■ 52.8
FUBP3Q96I24 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.223e-32■■■■■ 52.8
FUBP3Q96I24 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.133e-32■■■■■ 52.8
FUBP3Q96I24 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.115e-10■■■■■ 52.7
FUBP3Q96I24 FBXO5-201ENST00000229758 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.225e-10■■■■■ 52.7
FUBP3Q96I24 FBXO5-203ENST00000477822 2610 ntTSL 26.66□□□□□ -1.345e-10■■■■■ 52.7
FUBP3Q96I24 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.092e-10■■■■■ 52.7
FUBP3Q96I24 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.582e-10■■■■■ 52.7
FUBP3Q96I24 MELK-209ENST00000541717 2363 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.541e-9■■■■■ 52
FUBP3Q96I24 MELK-206ENST00000536329 2283 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.831e-9■■■■■ 52
FUBP3Q96I24 MELK-201ENST00000298048 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -11e-9■■■■■ 52
FUBP3Q96I24 MELK-208ENST00000536987 2125 ntTSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.081e-9■■■■■ 52
FUBP3Q96I24 MELK-211ENST00000545008 2236 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.191e-9■■■■■ 52
FUBP3Q96I24 MELK-207ENST00000536860 2342 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.231e-9■■■■■ 52
FUBP3Q96I24 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.451e-9■■■■■ 52
FUBP3Q96I24 PLSCR4-202ENST00000383083 3033 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.372e-6■■■■■ 50.6
FUBP3Q96I24 PLSCR4-203ENST00000433593 2839 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.52e-6■■■■■ 50.6
FUBP3Q96I24 PLSCR4-201ENST00000354952 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.732e-6■■■■■ 50.6
FUBP3Q96I24 C4orf46-201ENST00000379205 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.921e-9■■■■■ 50.2
FUBP3Q96I24 C4orf46-202ENST00000508457 3358 ntTSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.111e-9■■■■■ 50.2
FUBP3Q96I24 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.992e-11■■■■■ 49.7
FUBP3Q96I24 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.892e-11■■■■■ 49.7
FUBP3Q96I24 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.021e-6■■■■■ 48.8
FUBP3Q96I24 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.121e-6■■■■■ 48.8
FUBP3Q96I24 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.613e-11■■■■■ 48.5
FUBP3Q96I24 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.453e-11■■■■■ 48.5
FUBP3Q96I24 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.363e-11■■■■■ 48.5
FUBP3Q96I24 SDCBP-212ENST00000523483 3589 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.843e-11■■■■■ 48.5
Retrieved 100 of 4,568 protein–RNA pairs in 33.9 ms