RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP33.36■■■□□ 2.93
RABGGTB-201ENST00000319942 CHIC1Q5VXU3 224 aa31.3■■■□□ 2.6
RABGGTB-201ENST00000319942 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP28.68■■■□□ 2.18
RABGGTB-201ENST00000319942 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
RABGGTB-201ENST00000319942 FOXD1Q16676 465 aa26.72■■□□□ 1.87
RABGGTB-201ENST00000319942 POTEDQ86YR6 584 aa25.67■■□□□ 1.7
RABGGTB-201ENST00000319942 MSH5O43196 834 aa25.34■■□□□ 1.65
RABGGTB-201ENST00000319942 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
RABGGTB-201ENST00000319942 PLPPR3Q6T4P5 718 aa24.67■■□□□ 1.54
RABGGTB-201ENST00000319942 PPP6R1Q9UPN7 881 aa24.46■■□□□ 1.51
RABGGTB-201ENST00000319942 ADRA2BP18089 450 aa24.36■■□□□ 1.49
RABGGTB-201ENST00000319942 DMRT2Q9Y5R5 561 aa22.63■■□□□ 1.21
RABGGTB-201ENST00000319942 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
RABGGTB-201ENST00000319942 NISCHQ9Y2I1 1504 aa22.5■■□□□ 1.19
RABGGTB-201ENST00000319942 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
RABGGTB-201ENST00000319942 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
RABGGTB-201ENST00000319942 DCAF8L1A6NGE4 600 aa21.67■■□□□ 1.06
RABGGTB-201ENST00000319942 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
RABGGTB-201ENST00000319942 RNF39Q9H2S5 420 aa21.52■■□□□ 1.03
RABGGTB-201ENST00000319942 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa21.5■■□□□ 1.03
RABGGTB-201ENST00000319942 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa21.28■■□□□ 1
RABGGTB-201ENST00000319942 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP21.25■□□□□ 0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP21.22■□□□□ 0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 DNAJC5BQ9UF47 199 aa21.04■□□□□ 0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP20.53■□□□□ 0.889e-8■□□□□ 10.2
RABGGTB-201ENST00000319942 NPM3O75607 178 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 POTEHQ6S545 545 aa20.02■□□□□ 0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 DSG3P32926 999 aa19.92■□□□□ 0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 CAPN15O75808 1086 aa19.9■□□□□ 0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP19.86■□□□□ 0.77
RABGGTB-201ENST00000319942 APLP2Q06481 763 aa19.54■□□□□ 0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa19.48■□□□□ 0.71
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP19.44■□□□□ 0.7
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC4A2P04920 1241 aa19.41■□□□□ 0.7
RABGGTB-201ENST00000319942 TRHP20396 242 aaPredicted RBP19.41■□□□□ 0.7
RABGGTB-201ENST00000319942 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP19.35■□□□□ 0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP19.35■□□□□ 0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 ABCB7O75027 752 aa19.33■□□□□ 0.68
RABGGTB-201ENST00000319942 KCNA4P22459 653 aa19.22■□□□□ 0.67
RABGGTB-201ENST00000319942 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP19.18■□□□□ 0.66
RABGGTB-201ENST00000319942 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP19.13■□□□□ 0.65
RABGGTB-201ENST00000319942 CHRDL2Q6WN34 429 aa18.87■□□□□ 0.61
RABGGTB-201ENST00000319942 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP18.86■□□□□ 0.61
RABGGTB-201ENST00000319942 DCAF8L2P0C7V8 631 aa18.83■□□□□ 0.6
RABGGTB-201ENST00000319942 POLA2Q14181 598 aa18.76■□□□□ 0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa18.61■□□□□ 0.57
RABGGTB-201ENST00000319942 ABCC9O60706 1549 aa18.56■□□□□ 0.56
RABGGTB-201ENST00000319942 AKT1S1Q96B36 256 aa18.52■□□□□ 0.56
RABGGTB-201ENST00000319942 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
RABGGTB-201ENST00000319942 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
RABGGTB-201ENST00000319942 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa18.43■□□□□ 0.54
RABGGTB-201ENST00000319942 MYO15BQ96JP2 1530 aa18.41■□□□□ 0.54
RABGGTB-201ENST00000319942 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
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RABGGTB-201ENST00000319942 PIP4P2Q8N4L2 257 aa18.27■□□□□ 0.52
RABGGTB-201ENST00000319942 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
RABGGTB-201ENST00000319942 FOXD4L1Q9NU39 408 aa18.2■□□□□ 0.5
RABGGTB-201ENST00000319942 OSCARQ8IYS5 282 aa18.18■□□□□ 0.5
RABGGTB-201ENST00000319942 HAX1O00165 279 aa18.12■□□□□ 0.49
RABGGTB-201ENST00000319942 PITPNM1O00562 1244 aa18.1■□□□□ 0.49
RABGGTB-201ENST00000319942 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa18.1■□□□□ 0.49
RABGGTB-201ENST00000319942 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP18.09■□□□□ 0.49
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
RABGGTB-201ENST00000319942 SCRIBQ14160 1630 aa17.95■□□□□ 0.46
RABGGTB-201ENST00000319942 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP17.85■□□□□ 0.45
RABGGTB-201ENST00000319942 SPDYE2BA6NHP3 402 aa17.79■□□□□ 0.44
RABGGTB-201ENST00000319942 SPDYE6P0CI01 402 aa17.79■□□□□ 0.44
RABGGTB-201ENST00000319942 SPDYE2Q495Y8 402 aa17.79■□□□□ 0.44
RABGGTB-201ENST00000319942 ATXN8OSP0DMR3 200 aa17.76■□□□□ 0.43
RABGGTB-201ENST00000319942 EVX2Q03828 476 aa17.75■□□□□ 0.43
RABGGTB-201ENST00000319942 FBLN2P98095 1184 aa17.7■□□□□ 0.42
RABGGTB-201ENST00000319942 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP17.63■□□□□ 0.41
RABGGTB-201ENST00000319942 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP17.63■□□□□ 0.41
RABGGTB-201ENST00000319942 ZBTB22O15209 634 aa17.62■□□□□ 0.41
RABGGTB-201ENST00000319942 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP17.62■□□□□ 0.41
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RABGGTB-201ENST00000319942 C19orf67A6NJJ6 358 aa17.54■□□□□ 0.4
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RABGGTB-201ENST00000319942 CECR2Q9BXF3 1484 aa17.48■□□□□ 0.39
RABGGTB-201ENST00000319942 UNC13AQ9UPW8 1703 aa17.47■□□□□ 0.39
RABGGTB-201ENST00000319942 BICRAQ9NZM4 1560 aa17.46■□□□□ 0.39
RABGGTB-201ENST00000319942 SSUH2Q9Y2M2 353 aa17.45■□□□□ 0.38
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RABGGTB-201ENST00000319942 MROH2BQ7Z745 1585 aa17.35■□□□□ 0.37
RABGGTB-201ENST00000319942 LHX8Q68G74 356 aa17.33■□□□□ 0.37
RABGGTB-201ENST00000319942 CHADLQ6NUI6 762 aa17.24■□□□□ 0.35
RABGGTB-201ENST00000319942 PRR29P0C7W0 189 aa17.22■□□□□ 0.35
RABGGTB-201ENST00000319942 SMARCA4P51532 1647 aa17.21■□□□□ 0.35
RABGGTB-201ENST00000319942 WIZO95785 1651 aa17.13■□□□□ 0.33
RABGGTB-201ENST00000319942 CLCN6P51797 869 aa17.07■□□□□ 0.32
RABGGTB-201ENST00000319942 CD44P16070 742 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
RABGGTB-201ENST00000319942 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa17.04■□□□□ 0.32
RABGGTB-201ENST00000319942 PEG3Q9GZU2 1588 aa17.03■□□□□ 0.32
RABGGTB-201ENST00000319942 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.32
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