RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459697.1

RABGGTB-203, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 1,177 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-203ENST00000459697 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
RABGGTB-203ENST00000459697 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.05■■□□□ 1.28
RABGGTB-203ENST00000459697 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
RABGGTB-203ENST00000459697 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
RABGGTB-203ENST00000459697 FOXD1Q16676 465 aa19.33■□□□□ 0.68
RABGGTB-203ENST00000459697 PLPPR3Q6T4P5 718 aa18.43■□□□□ 0.54
RABGGTB-203ENST00000459697 MSH5O43196 834 aa18.13■□□□□ 0.49
RABGGTB-203ENST00000459697 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
RABGGTB-203ENST00000459697 PPP6R1Q9UPN7 881 aa18.05■□□□□ 0.48
RABGGTB-203ENST00000459697 ADRA2BP18089 450 aa18.01■□□□□ 0.47
RABGGTB-203ENST00000459697 POTEDQ86YR6 584 aa17.72■□□□□ 0.43
RABGGTB-203ENST00000459697 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
RABGGTB-203ENST00000459697 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
RABGGTB-203ENST00000459697 DMRT2Q9Y5R5 561 aa16.44■□□□□ 0.22
RABGGTB-203ENST00000459697 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa16.15■□□□□ 0.18
RABGGTB-203ENST00000459697 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa15.85■□□□□ 0.13
RABGGTB-203ENST00000459697 DCAF8L1A6NGE4 600 aa15.83■□□□□ 0.12
RABGGTB-203ENST00000459697 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP15.82■□□□□ 0.12
RABGGTB-203ENST00000459697 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP15.71■□□□□ 0.11
RABGGTB-203ENST00000459697 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
RABGGTB-203ENST00000459697 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
RABGGTB-203ENST00000459697 RNF39Q9H2S5 420 aa15.44■□□□□ 0.06
RABGGTB-203ENST00000459697 NPM3O75607 178 aaKnown RBP15.28■□□□□ 0.04
RABGGTB-203ENST00000459697 DNAJC5BQ9UF47 199 aa15.28■□□□□ 0.04
RABGGTB-203ENST00000459697 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
RABGGTB-203ENST00000459697 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP15.13■□□□□ 0.018e-9■□□□□ 8.8
RABGGTB-203ENST00000459697 KCNA4P22459 653 aa14.96□□□□□ -0.01
RABGGTB-203ENST00000459697 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
RABGGTB-203ENST00000459697 SLC4A2P04920 1241 aa14.59□□□□□ -0.07
RABGGTB-203ENST00000459697 CAPN15O75808 1086 aa14.57□□□□□ -0.08
RABGGTB-203ENST00000459697 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
RABGGTB-203ENST00000459697 DSG3P32926 999 aa14.46□□□□□ -0.09
RABGGTB-203ENST00000459697 APLP2Q06481 763 aa14.4□□□□□ -0.1
RABGGTB-203ENST00000459697 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP14.38□□□□□ -0.11
RABGGTB-203ENST00000459697 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP14.38□□□□□ -0.11
RABGGTB-203ENST00000459697 TRHP20396 242 aaPredicted RBP14.34□□□□□ -0.11
RABGGTB-203ENST00000459697 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP14.29□□□□□ -0.12
RABGGTB-203ENST00000459697 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP14.28□□□□□ -0.12
RABGGTB-203ENST00000459697 ABCB7O75027 752 aa14.22□□□□□ -0.13
RABGGTB-203ENST00000459697 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP14.15□□□□□ -0.14
RABGGTB-203ENST00000459697 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP14.14□□□□□ -0.15
RABGGTB-203ENST00000459697 FOXD4L1Q9NU39 408 aa13.99□□□□□ -0.17
RABGGTB-203ENST00000459697 POLA2Q14181 598 aa13.94□□□□□ -0.18
RABGGTB-203ENST00000459697 POTEHQ6S545 545 aa13.9□□□□□ -0.18
RABGGTB-203ENST00000459697 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP13.83□□□□□ -0.2
RABGGTB-203ENST00000459697 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP13.8□□□□□ -0.2
RABGGTB-203ENST00000459697 ZBTB22O15209 634 aa13.73□□□□□ -0.21
RABGGTB-203ENST00000459697 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
RABGGTB-203ENST00000459697 ATXN8OSP0DMR3 200 aa13.55□□□□□ -0.24
RABGGTB-203ENST00000459697 CHRDL2Q6WN34 429 aa13.52□□□□□ -0.25
RABGGTB-203ENST00000459697 AKT1S1Q96B36 256 aa13.49□□□□□ -0.25
RABGGTB-203ENST00000459697 OSCARQ8IYS5 282 aa13.47□□□□□ -0.25
RABGGTB-203ENST00000459697 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
RABGGTB-203ENST00000459697 FBLN2P98095 1184 aa13.32□□□□□ -0.28
RABGGTB-203ENST00000459697 SPDYE2BA6NHP3 402 aa13.21□□□□□ -0.29
RABGGTB-203ENST00000459697 PITPNM1O00562 1244 aa13.21□□□□□ -0.29
RABGGTB-203ENST00000459697 SPDYE6P0CI01 402 aa13.21□□□□□ -0.29
RABGGTB-203ENST00000459697 SPDYE2Q495Y8 402 aa13.21□□□□□ -0.29
RABGGTB-203ENST00000459697 PIP4P2Q8N4L2 257 aa13.18□□□□□ -0.3
RABGGTB-203ENST00000459697 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP13.16□□□□□ -0.3
RABGGTB-203ENST00000459697 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP13.1□□□□□ -0.31
RABGGTB-203ENST00000459697 CSRNP3Q8WYN3 585 aa13.1□□□□□ -0.31
RABGGTB-203ENST00000459697 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
RABGGTB-203ENST00000459697 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
RABGGTB-203ENST00000459697 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
RABGGTB-203ENST00000459697 CLEC11AQ9Y240 323 aa13.01□□□□□ -0.33
RABGGTB-203ENST00000459697 SSUH2Q9Y2M2 353 aa13.01□□□□□ -0.33
RABGGTB-203ENST00000459697 HAX1O00165 279 aa12.99□□□□□ -0.33
RABGGTB-203ENST00000459697 EHMT2Q96KQ7 1210 aa12.94□□□□□ -0.34
RABGGTB-203ENST00000459697 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
RABGGTB-203ENST00000459697 ABCC9O60706 1549 aa12.88□□□□□ -0.35
RABGGTB-203ENST00000459697 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP12.87□□□□□ -0.35
RABGGTB-203ENST00000459697 PRR29P0C7W0 189 aa12.79□□□□□ -0.36
RABGGTB-203ENST00000459697 EVX2Q03828 476 aa12.78□□□□□ -0.36
RABGGTB-203ENST00000459697 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa12.75□□□□□ -0.37
RABGGTB-203ENST00000459697 CHADLQ6NUI6 762 aa12.73□□□□□ -0.37
RABGGTB-203ENST00000459697 C19orf67A6NJJ6 358 aa12.68□□□□□ -0.38
RABGGTB-203ENST00000459697 SPDYE4A6NLX3 237 aa12.57□□□□□ -0.4
RABGGTB-203ENST00000459697 NISCHQ9Y2I1 1504 aa12.54□□□□□ -0.4
RABGGTB-203ENST00000459697 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP12.54□□□□□ -0.4
RABGGTB-203ENST00000459697 STAG3Q9UJ98 1225 aa12.53□□□□□ -0.4
RABGGTB-203ENST00000459697 GABBR2O75899 941 aa12.51□□□□□ -0.41
RABGGTB-203ENST00000459697 CD44P16070 742 aaKnown RBP12.48□□□□□ -0.41
RABGGTB-203ENST00000459697 CREBZFQ9NS37 354 aa12.42□□□□□ -0.42
RABGGTB-203ENST00000459697 CLCN6P51797 869 aa12.32□□□□□ -0.44
RABGGTB-203ENST00000459697 ZRANB1Q9UGI0 708 aa12.31□□□□□ -0.44
RABGGTB-203ENST00000459697 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
RABGGTB-203ENST00000459697 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP12.23□□□□□ -0.45
RABGGTB-203ENST00000459697 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP12.23□□□□□ -0.45
RABGGTB-203ENST00000459697 POTEIP0CG38 1075 aa12.22□□□□□ -0.45
RABGGTB-203ENST00000459697 LHX8Q68G74 356 aa12.22□□□□□ -0.45
RABGGTB-203ENST00000459697 DCBLD2Q96PD2 775 aa12.21□□□□□ -0.45
RABGGTB-203ENST00000459697 PROM2Q8N271 834 aa12.2□□□□□ -0.46
RABGGTB-203ENST00000459697 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP12.18□□□□□ -0.46
RABGGTB-203ENST00000459697 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
RABGGTB-203ENST00000459697 PHF12Q96QT6 1004 aa12.11□□□□□ -0.47
RABGGTB-203ENST00000459697 PLEKHG5O94827 1062 aa12.03□□□□□ -0.48
RABGGTB-203ENST00000459697 MIER1Q8N108 512 aa12.02□□□□□ -0.49
RABGGTB-203ENST00000459697 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP12.01□□□□□ -0.49
RABGGTB-203ENST00000459697 MS4A3Q96HJ5 214 aa11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.5 ms