RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258341.4

LAMC1-201, Transcript of laminin subunit gamma 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LAMC1, Length 7,889 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1-201ENST00000258341 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.24■■■□□ 2.11
LAMC1-201ENST00000258341 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
LAMC1-201ENST00000258341 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
LAMC1-201ENST00000258341 EHMT2Q96KQ7 1210 aa26.32■■□□□ 1.8
LAMC1-201ENST00000258341 APLP2Q06481 763 aa25.84■■□□□ 1.73
LAMC1-201ENST00000258341 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.79■■□□□ 1.72
LAMC1-201ENST00000258341 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
LAMC1-201ENST00000258341 ERICH6Q7L0X2 663 aa25.58■■□□□ 1.68
LAMC1-201ENST00000258341 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
LAMC1-201ENST00000258341 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
LAMC1-201ENST00000258341 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
LAMC1-201ENST00000258341 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
LAMC1-201ENST00000258341 PCGF6Q9BYE7 350 aa25.04■■□□□ 1.6
LAMC1-201ENST00000258341 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
LAMC1-201ENST00000258341 NISCHQ9Y2I1 1504 aa24.88■■□□□ 1.57
LAMC1-201ENST00000258341 NEFLP07196 543 aa24.75■■□□□ 1.55
LAMC1-201ENST00000258341 MYT1Q01538 1121 aa24.55■■□□□ 1.52
LAMC1-201ENST00000258341 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
LAMC1-201ENST00000258341 MYT1LQ9UL68 1186 aa24.5■■□□□ 1.51
LAMC1-201ENST00000258341 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
LAMC1-201ENST00000258341 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
LAMC1-201ENST00000258341 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.46■■□□□ 1.51
LAMC1-201ENST00000258341 UBTFP17480 764 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
LAMC1-201ENST00000258341 TRIM41Q8WV44 630 aa24.36■■□□□ 1.49
LAMC1-201ENST00000258341 POLR3GLQ9BT43 218 aa24.26■■□□□ 1.47
LAMC1-201ENST00000258341 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
LAMC1-201ENST00000258341 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
LAMC1-201ENST00000258341 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
LAMC1-201ENST00000258341 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
LAMC1-201ENST00000258341 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
LAMC1-201ENST00000258341 ITGAEP38570 1179 aa23.94■■□□□ 1.42
LAMC1-201ENST00000258341 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
LAMC1-201ENST00000258341 CLSPNQ9HAW4 1339 aa23.79■■□□□ 1.4
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LAMC1-201ENST00000258341 SLC24A1O60721 1099 aa23.49■■□□□ 1.35
LAMC1-201ENST00000258341 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
LAMC1-201ENST00000258341 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
LAMC1-201ENST00000258341 BCL11AQ9H165 835 aa23.33■■□□□ 1.33
LAMC1-201ENST00000258341 HRCP23327 699 aa23.25■■□□□ 1.31
LAMC1-201ENST00000258341 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
LAMC1-201ENST00000258341 BCANQ96GW7 911 aa23.18■■□□□ 1.3
LAMC1-201ENST00000258341 TRIM52Q96A61 297 aa23.15■■□□□ 1.3
LAMC1-201ENST00000258341 PLPPR3Q6T4P5 718 aa23.12■■□□□ 1.29
LAMC1-201ENST00000258341 CANXP27824 592 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
LAMC1-201ENST00000258341 NEUROD1Q13562 356 aa23.04■■□□□ 1.28
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LAMC1-201ENST00000258341 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
LAMC1-201ENST00000258341 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa23■■□□□ 1.27
LAMC1-201ENST00000258341 NEFMP07197 916 aa22.97■■□□□ 1.27
LAMC1-201ENST00000258341 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
LAMC1-201ENST00000258341 ANP32CO43423 234 aa22.85■■□□□ 1.25
LAMC1-201ENST00000258341 FBLN2P98095 1184 aa22.8■■□□□ 1.24
LAMC1-201ENST00000258341 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
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LAMC1-201ENST00000258341 A0A0G2JS52 829 aa22.62■■□□□ 1.21
LAMC1-201ENST00000258341 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
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LAMC1-201ENST00000258341 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
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LAMC1-201ENST00000258341 STAG3Q9UJ98 1225 aa22.49■■□□□ 1.19
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LAMC1-201ENST00000258341 ARID3CA6NKF2 412 aa22.45■■□□□ 1.19
LAMC1-201ENST00000258341 PLEKHG5O94827 1062 aa22.41■■□□□ 1.18
LAMC1-201ENST00000258341 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
LAMC1-201ENST00000258341 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
LAMC1-201ENST00000258341 CHGAP10645 457 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
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LAMC1-201ENST00000258341 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
LAMC1-201ENST00000258341 P3H3Q8IVL6 736 aa22.31■■□□□ 1.16
LAMC1-201ENST00000258341 ARXQ96QS3 562 aa22.24■■□□□ 1.15
LAMC1-201ENST00000258341 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
LAMC1-201ENST00000258341 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa22.19■■□□□ 1.14
LAMC1-201ENST00000258341 ABCC9O60706 1549 aa22.18■■□□□ 1.14
LAMC1-201ENST00000258341 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
LAMC1-201ENST00000258341 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
LAMC1-201ENST00000258341 ZBTB7CA1YPR0 619 aa22.12■■□□□ 1.13
LAMC1-201ENST00000258341 FAM9BQ8IZU0 186 aa22.07■■□□□ 1.12
LAMC1-201ENST00000258341 NBR1Q14596 966 aa22.06■■□□□ 1.12
LAMC1-201ENST00000258341 FKBP8Q14318 412 aa22.06■■□□□ 1.12
LAMC1-201ENST00000258341 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
LAMC1-201ENST00000258341 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP22.05■■□□□ 1.12
LAMC1-201ENST00000258341 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP22.01■■□□□ 1.111e-7■■■□□ 18.2
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LAMC1-201ENST00000258341 MYH16Q9H6N6 1097 aa22.01■■□□□ 1.11
LAMC1-201ENST00000258341 TONSLQ96HA7 1378 aa22.01■■□□□ 1.11
LAMC1-201ENST00000258341 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP21.99■■□□□ 1.11
LAMC1-201ENST00000258341 TMC1Q8TDI8 760 aa21.99■■□□□ 1.11
LAMC1-201ENST00000258341 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
LAMC1-201ENST00000258341 C14orf37Q86TY3 774 aa21.97■■□□□ 1.11
LAMC1-201ENST00000258341 CCDC136Q96JN2 1154 aa21.93■■□□□ 1.1
LAMC1-201ENST00000258341 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
LAMC1-201ENST00000258341 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa21.84■■□□□ 1.09
LAMC1-201ENST00000258341 NCLP19338 710 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
LAMC1-201ENST00000258341 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
LAMC1-201ENST00000258341 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
LAMC1-201ENST00000258341 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
LAMC1-201ENST00000258341 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
LAMC1-201ENST00000258341 TPRNQ4KMQ1 711 aa21.76■■□□□ 1.07
LAMC1-201ENST00000258341 NPHP1O15259 732 aa21.75■■□□□ 1.07
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