RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496055.5

RABGGTB-213, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 3,863 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-213ENST00000496055 NISCHQ9Y2I1 1504 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGGTB-213ENST00000496055 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
RABGGTB-213ENST00000496055 ABCC9O60706 1549 aa8.98□□□□□ -0.97
RABGGTB-213ENST00000496055 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa8.87□□□□□ -0.99
RABGGTB-213ENST00000496055 CHIC1Q5VXU3 224 aa8.8□□□□□ -1
RABGGTB-213ENST00000496055 DCAF8L2P0C7V8 631 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGGTB-213ENST00000496055 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGGTB-213ENST00000496055 NACADO15069 1562 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGGTB-213ENST00000496055 SLC24A1O60721 1099 aa8.46□□□□□ -1.05
RABGGTB-213ENST00000496055 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-213ENST00000496055 DNAJC5BQ9UF47 199 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGGTB-213ENST00000496055 MYT1Q01538 1121 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGGTB-213ENST00000496055 MYO15BQ96JP2 1530 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGGTB-213ENST00000496055 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
RABGGTB-213ENST00000496055 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGGTB-213ENST00000496055 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGGTB-213ENST00000496055 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
RABGGTB-213ENST00000496055 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
RABGGTB-213ENST00000496055 CECR2Q9BXF3 1484 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGGTB-213ENST00000496055 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
RABGGTB-213ENST00000496055 BICRAQ9NZM4 1560 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGGTB-213ENST00000496055 SCRIBQ14160 1630 aa8.09□□□□□ -1.12
RABGGTB-213ENST00000496055 UNC13AQ9UPW8 1703 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGGTB-213ENST00000496055 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
RABGGTB-213ENST00000496055 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGGTB-213ENST00000496055 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
RABGGTB-213ENST00000496055 APLP2Q06481 763 aa7.96□□□□□ -1.14
RABGGTB-213ENST00000496055 ERICH6Q7L0X2 663 aa7.9□□□□□ -1.14
RABGGTB-213ENST00000496055 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
RABGGTB-213ENST00000496055 ERCC6Q03468 1493 aa7.89□□□□□ -1.15
RABGGTB-213ENST00000496055 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa7.86□□□□□ -1.15
RABGGTB-213ENST00000496055 CUX2O14529 1486 aa7.82□□□□□ -1.16
RABGGTB-213ENST00000496055 SMARCA2P51531 1590 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGGTB-213ENST00000496055 NCAPD3P42695 1498 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGGTB-213ENST00000496055 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
RABGGTB-213ENST00000496055 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGGTB-213ENST00000496055 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
RABGGTB-213ENST00000496055 HMGXB3Q12766 1538 aa7.72□□□□□ -1.17
RABGGTB-213ENST00000496055 PDS5BQ9NTI5 1447 aa7.72□□□□□ -1.17
RABGGTB-213ENST00000496055 SMARCA4P51532 1647 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGGTB-213ENST00000496055 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa7.64□□□□□ -1.19
RABGGTB-213ENST00000496055 CADPSQ9ULU8 1353 aa7.62□□□□□ -1.19
RABGGTB-213ENST00000496055 NESP48681 1621 aa7.6□□□□□ -1.19
RABGGTB-213ENST00000496055 TRIM41Q8WV44 630 aa7.6□□□□□ -1.19
RABGGTB-213ENST00000496055 PEG3Q9GZU2 1588 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGGTB-213ENST00000496055 MRC2Q9UBG0 1479 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGGTB-213ENST00000496055 BCL11AQ9H165 835 aa7.56□□□□□ -1.2
RABGGTB-213ENST00000496055 CEP164Q9UPV0 1460 aa7.56□□□□□ -1.2
RABGGTB-213ENST00000496055 MROH2BQ7Z745 1585 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGGTB-213ENST00000496055 OSCARQ8IYS5 282 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGGTB-213ENST00000496055 FANCD2Q9BXW9 1451 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGGTB-213ENST00000496055 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
RABGGTB-213ENST00000496055 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
RABGGTB-213ENST00000496055 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-213ENST00000496055 WDR62O43379 1518 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-213ENST00000496055 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGGTB-213ENST00000496055 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
RABGGTB-213ENST00000496055 CFTRP13569 1480 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGGTB-213ENST00000496055 ABCC8Q09428 1581 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGGTB-213ENST00000496055 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
RABGGTB-213ENST00000496055 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
RABGGTB-213ENST00000496055 WIZO95785 1651 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-213ENST00000496055 PLPPR3Q6T4P5 718 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGGTB-213ENST00000496055 IFT140Q96RY7 1462 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGGTB-213ENST00000496055 FBLN2P98095 1184 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGGTB-213ENST00000496055 TRHP20396 242 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
RABGGTB-213ENST00000496055 PLEKHG5O94827 1062 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGGTB-213ENST00000496055 EHMT2Q96KQ7 1210 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-213ENST00000496055 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-213ENST00000496055 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
RABGGTB-213ENST00000496055 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
RABGGTB-213ENST00000496055 CYB5RLQ6IPT4 315 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTB-213ENST00000496055 CCDC88BA6NC98 1476 aa7.34□□□□□ -1.24
RABGGTB-213ENST00000496055 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
RABGGTB-213ENST00000496055 TOPBP1Q92547 1522 aa7.31□□□□□ -1.24
RABGGTB-213ENST00000496055 DNMBPQ6XZF7 1577 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGGTB-213ENST00000496055 SOGA1O94964 1423 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGGTB-213ENST00000496055 ARXQ96QS3 562 aa7.27□□□□□ -1.25
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
RABGGTB-213ENST00000496055 PRDM2Q13029 1718 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGGTB-213ENST00000496055 ARHGEF11O15085 1522 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGGTB-213ENST00000496055 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP7.26□□□□□ -1.257e-7■■■■□ 22.3
RABGGTB-213ENST00000496055 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
RABGGTB-213ENST00000496055 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
RABGGTB-213ENST00000496055 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa7.24□□□□□ -1.25
RABGGTB-213ENST00000496055 GRIN2BQ13224 1484 aa7.24□□□□□ -1.25
RABGGTB-213ENST00000496055 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP7.24□□□□□ -1.25
RABGGTB-213ENST00000496055 KLHL34Q8N239 644 aa7.24□□□□□ -1.25
RABGGTB-213ENST00000496055 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa7.23□□□□□ -1.25
RABGGTB-213ENST00000496055 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa7.23□□□□□ -1.25
RABGGTB-213ENST00000496055 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa7.23□□□□□ -1.25
RABGGTB-213ENST00000496055 WDR97A6NE52 1622 aa7.23□□□□□ -1.25
RABGGTB-213ENST00000496055 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
RABGGTB-213ENST00000496055 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
RABGGTB-213ENST00000496055 SYNJ1O43426 1573 aa7.23□□□□□ -1.25
RABGGTB-213ENST00000496055 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
RABGGTB-213ENST00000496055 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGGTB-213ENST00000496055 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
RABGGTB-213ENST00000496055 FGD5Q6ZNL6 1462 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGGTB-213ENST00000496055 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
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