Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC58.27■■■■■ 6.92
TRIM41Q8WV44 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC57.75■■■■■ 6.84
TRIM41Q8WV44 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC57.47■■■■■ 6.79
TRIM41Q8WV44 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.93■■■■■ 6.7
TRIM41Q8WV44 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.51■■■■■ 6.64
TRIM41Q8WV44 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC56.5■■■■■ 6.64
TRIM41Q8WV44 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC56.46■■■■■ 6.63
TRIM41Q8WV44 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.37■■■■■ 6.61
TRIM41Q8WV44 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC56.37■■■■■ 6.61
TRIM41Q8WV44 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.36■■■■■ 6.61
TRIM41Q8WV44 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC56.16■■■■■ 6.58
TRIM41Q8WV44 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC55.6■■■■■ 6.49
TRIM41Q8WV44 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC55.13■■■■■ 6.42
TRIM41Q8WV44 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC55.1■■■■■ 6.41
TRIM41Q8WV44 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC55.09■■■■■ 6.41
TRIM41Q8WV44 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC54.87■■■■■ 6.37
TRIM41Q8WV44 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC54.71■■■■■ 6.35
TRIM41Q8WV44 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.71■■■■■ 6.35
TRIM41Q8WV44 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.57■■■■■ 6.33
TRIM41Q8WV44 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC54.38■■■■■ 6.3
TRIM41Q8WV44 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC54.25■■■■■ 6.28
TRIM41Q8WV44 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC54.24■■■■■ 6.27
TRIM41Q8WV44 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC54.1■■■■■ 6.25
TRIM41Q8WV44 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC53.99■■■■■ 6.23
TRIM41Q8WV44 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.95■■■■■ 6.23
TRIM41Q8WV44 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC53.88■■■■■ 6.22
TRIM41Q8WV44 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC53.82■■■■■ 6.21
TRIM41Q8WV44 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC53.79■■■■■ 6.2
TRIM41Q8WV44 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC53.79■■■■■ 6.2
TRIM41Q8WV44 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC53.51■■■■■ 6.16
TRIM41Q8WV44 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC53.49■■■■■ 6.15
TRIM41Q8WV44 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC53.42■■■■■ 6.14
TRIM41Q8WV44 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.4■■■■■ 6.14
TRIM41Q8WV44 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC53.4■■■■■ 6.14
TRIM41Q8WV44 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC53.15■■■■■ 6.1
TRIM41Q8WV44 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC53.05■■■■■ 6.08
TRIM41Q8WV44 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC53.02■■■■■ 6.08
TRIM41Q8WV44 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.95■■■■■ 6.07
TRIM41Q8WV44 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC52.86■■■■■ 6.05
TRIM41Q8WV44 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC52.64■■■■■ 6.02
TRIM41Q8WV44 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.6■■■■■ 6.01
TRIM41Q8WV44 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC52.47■■■■■ 5.99
TRIM41Q8WV44 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC52.44■■■■■ 5.99
TRIM41Q8WV44 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC52.41■■■■■ 5.98
TRIM41Q8WV44 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC52.33■■■■■ 5.97
TRIM41Q8WV44 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC52.31■■■■■ 5.96
TRIM41Q8WV44 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC52.31■■■■■ 5.96
TRIM41Q8WV44 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC52.18■■■■■ 5.94
TRIM41Q8WV44 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC52.04■■■■■ 5.92
TRIM41Q8WV44 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC52.02■■■■■ 5.92
TRIM41Q8WV44 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC52.01■■■■■ 5.92
TRIM41Q8WV44 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC52.01■■■■■ 5.92
TRIM41Q8WV44 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC51.89■■■■■ 5.9
TRIM41Q8WV44 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC51.87■■■■■ 5.89
TRIM41Q8WV44 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC51.86■■■■■ 5.89
TRIM41Q8WV44 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.84■■■■■ 5.89
TRIM41Q8WV44 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC51.81■■■■■ 5.88
TRIM41Q8WV44 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.75■■■■■ 5.87
TRIM41Q8WV44 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC51.75■■■■■ 5.87
TRIM41Q8WV44 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.74■■■■■ 5.87
TRIM41Q8WV44 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC51.71■■■■■ 5.87
TRIM41Q8WV44 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC51.71■■■■■ 5.87
TRIM41Q8WV44 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC51.69■■■■■ 5.87
TRIM41Q8WV44 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC51.49■■■■■ 5.83
TRIM41Q8WV44 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC51.46■■■■■ 5.83
TRIM41Q8WV44 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC51.41■■■■■ 5.82
TRIM41Q8WV44 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.4■■■■■ 5.82
TRIM41Q8WV44 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.38■■■■■ 5.82
TRIM41Q8WV44 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC51.38■■■■■ 5.82
TRIM41Q8WV44 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC51.34■■■■■ 5.81
TRIM41Q8WV44 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC51.34■■■■■ 5.81
TRIM41Q8WV44 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC51.23■■■■■ 5.79
TRIM41Q8WV44 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC51.23■■■■■ 5.79
TRIM41Q8WV44 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC51.21■■■■■ 5.79
TRIM41Q8WV44 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC51.18■■■■■ 5.78
TRIM41Q8WV44 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC51.16■■■■■ 5.78
TRIM41Q8WV44 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC51.15■■■■■ 5.78
TRIM41Q8WV44 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC51.06■■■■■ 5.76
TRIM41Q8WV44 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC51.01■■■■■ 5.76
TRIM41Q8WV44 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC51.01■■■■■ 5.76
TRIM41Q8WV44 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC51■■■■■ 5.75
TRIM41Q8WV44 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC50.94■■■■■ 5.75
TRIM41Q8WV44 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC50.88■■■■■ 5.74
TRIM41Q8WV44 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC50.88■■■■■ 5.74
TRIM41Q8WV44 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.83■■■■■ 5.73
TRIM41Q8WV44 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.81■■■■■ 5.73
TRIM41Q8WV44 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC50.81■■■■■ 5.72
TRIM41Q8WV44 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC50.78■■■■■ 5.72
TRIM41Q8WV44 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC50.75■■■■■ 5.71
TRIM41Q8WV44 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC50.74■■■■■ 5.71
TRIM41Q8WV44 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC50.68■■■■■ 5.7
TRIM41Q8WV44 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC50.62■■■■■ 5.69
TRIM41Q8WV44 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.6■■■■■ 5.69
TRIM41Q8WV44 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC50.52■■■■■ 5.68
TRIM41Q8WV44 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.51■■■■■ 5.68
TRIM41Q8WV44 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.45■■■■■ 5.67
TRIM41Q8WV44 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC50.41■■■■■ 5.66
TRIM41Q8WV44 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC50.4■■■■■ 5.66
TRIM41Q8WV44 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC50.29■■■■■ 5.64
TRIM41Q8WV44 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC50.24■■■■■ 5.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms