Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.23■■■■■ 5.63
TRIM41Q8WV44 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC50.21■■■■■ 5.63
TRIM41Q8WV44 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC50.16■■■■■ 5.62
TRIM41Q8WV44 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.11■■■■■ 5.61
TRIM41Q8WV44 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.1■■■■■ 5.61
TRIM41Q8WV44 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.09■■■■■ 5.61
TRIM41Q8WV44 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC50.08■■■■■ 5.61
TRIM41Q8WV44 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC50.02■■■■■ 5.6
TRIM41Q8WV44 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC50■■■■■ 5.59
TRIM41Q8WV44 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.98■■■■■ 5.59
TRIM41Q8WV44 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.97■■■■■ 5.59
TRIM41Q8WV44 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC49.97■■■■■ 5.59
TRIM41Q8WV44 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.95■■■■■ 5.59
TRIM41Q8WV44 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC49.91■■■■■ 5.58
TRIM41Q8WV44 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.88■■■■■ 5.58
TRIM41Q8WV44 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.86■■■■■ 5.57
TRIM41Q8WV44 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC49.85■■■■■ 5.57
TRIM41Q8WV44 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.79■■■■■ 5.56
TRIM41Q8WV44 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC49.78■■■■■ 5.56
TRIM41Q8WV44 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.77■■■■■ 5.56
TRIM41Q8WV44 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC49.76■■■■■ 5.56
TRIM41Q8WV44 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC49.76■■■■■ 5.56
TRIM41Q8WV44 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC49.74■■■■■ 5.55
TRIM41Q8WV44 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC49.71■■■■■ 5.55
TRIM41Q8WV44 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC49.71■■■■■ 5.55
TRIM41Q8WV44 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC49.7■■■■■ 5.55
TRIM41Q8WV44 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.69■■■■■ 5.55
TRIM41Q8WV44 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.68■■■■■ 5.54
TRIM41Q8WV44 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC49.68■■■■■ 5.54
TRIM41Q8WV44 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.67■■■■■ 5.54
TRIM41Q8WV44 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49.66■■■■■ 5.54
TRIM41Q8WV44 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC49.56■■■■■ 5.52
TRIM41Q8WV44 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.55■■■■■ 5.52
TRIM41Q8WV44 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.53■■■■■ 5.52
TRIM41Q8WV44 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.51■■■■■ 5.52
TRIM41Q8WV44 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.5■■■■■ 5.51
TRIM41Q8WV44 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC49.5■■■■■ 5.51
TRIM41Q8WV44 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.49■■■■■ 5.51
TRIM41Q8WV44 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC49.46■■■■■ 5.51
TRIM41Q8WV44 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC49.45■■■■■ 5.51
TRIM41Q8WV44 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.44■■■■■ 5.51
TRIM41Q8WV44 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC49.44■■■■■ 5.51
TRIM41Q8WV44 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC49.44■■■■■ 5.51
TRIM41Q8WV44 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.42■■■■■ 5.5
TRIM41Q8WV44 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC49.34■■■■■ 5.49
TRIM41Q8WV44 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.32■■■■■ 5.49
TRIM41Q8WV44 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.3■■■■■ 5.48
TRIM41Q8WV44 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC49.29■■■■■ 5.48
TRIM41Q8WV44 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.29■■■■■ 5.48
TRIM41Q8WV44 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC49.24■■■■■ 5.47
TRIM41Q8WV44 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC49.19■■■■■ 5.46
TRIM41Q8WV44 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC49.18■■■■■ 5.46
TRIM41Q8WV44 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC49.12■■■■■ 5.45
TRIM41Q8WV44 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.12■■■■■ 5.45
TRIM41Q8WV44 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC49.09■■■■■ 5.45
TRIM41Q8WV44 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC49.06■■■■■ 5.44
TRIM41Q8WV44 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC49.05■■■■■ 5.44
TRIM41Q8WV44 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC49.04■■■■■ 5.44
TRIM41Q8WV44 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.03■■■■■ 5.44
TRIM41Q8WV44 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.01■■■■■ 5.44
TRIM41Q8WV44 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC49.01■■■■■ 5.44
TRIM41Q8WV44 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC49■■■■■ 5.43
TRIM41Q8WV44 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC49■■■■■ 5.43
TRIM41Q8WV44 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.98■■■■■ 5.43
TRIM41Q8WV44 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC48.95■■■■■ 5.43
TRIM41Q8WV44 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC48.94■■■■■ 5.43
TRIM41Q8WV44 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.94■■■■■ 5.43
TRIM41Q8WV44 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC48.89■■■■■ 5.42
TRIM41Q8WV44 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.83■■■■■ 5.41
TRIM41Q8WV44 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC48.81■■■■■ 5.4
TRIM41Q8WV44 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC48.8■■■■■ 5.4
TRIM41Q8WV44 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.78■■■■■ 5.4
TRIM41Q8WV44 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.76■■■■■ 5.4
TRIM41Q8WV44 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC48.76■■■■■ 5.4
TRIM41Q8WV44 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC48.75■■■■■ 5.4
TRIM41Q8WV44 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC48.74■■■■■ 5.39
TRIM41Q8WV44 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC48.73■■■■■ 5.39
TRIM41Q8WV44 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC48.71■■■■■ 5.39
TRIM41Q8WV44 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC48.68■■■■■ 5.38
TRIM41Q8WV44 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC48.68■■■■■ 5.38
TRIM41Q8WV44 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC48.66■■■■■ 5.38
TRIM41Q8WV44 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC48.65■■■■■ 5.38
TRIM41Q8WV44 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.65■■■■■ 5.38
TRIM41Q8WV44 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC48.65■■■■■ 5.38
TRIM41Q8WV44 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC48.64■■■■■ 5.38
TRIM41Q8WV44 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.61■■■■■ 5.37
TRIM41Q8WV44 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC48.61■■■■■ 5.37
TRIM41Q8WV44 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC48.58■■■■■ 5.37
TRIM41Q8WV44 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.57■■■■■ 5.37
TRIM41Q8WV44 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC48.56■■■■■ 5.36
TRIM41Q8WV44 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.56■■■■■ 5.36
TRIM41Q8WV44 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.55■■■■■ 5.36
TRIM41Q8WV44 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.54■■■■■ 5.36
TRIM41Q8WV44 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.54■■■■■ 5.36
TRIM41Q8WV44 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC48.53■■■■■ 5.36
TRIM41Q8WV44 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC48.52■■■■■ 5.36
TRIM41Q8WV44 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.52■■■■■ 5.36
TRIM41Q8WV44 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC48.48■■■■■ 5.35
TRIM41Q8WV44 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC48.48■■■■■ 5.35
TRIM41Q8WV44 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC48.44■■■■■ 5.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms