Protein–RNA interactions for Protein: Q86VX2

COMMD7, COMM domain-containing protein 7, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD7Q86VX2 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
COMMD7Q86VX2 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
COMMD7Q86VX2 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
COMMD7Q86VX2 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
COMMD7Q86VX2 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
COMMD7Q86VX2 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
COMMD7Q86VX2 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
COMMD7Q86VX2 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
COMMD7Q86VX2 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
COMMD7Q86VX2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
COMMD7Q86VX2 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
COMMD7Q86VX2 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
COMMD7Q86VX2 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
COMMD7Q86VX2 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
COMMD7Q86VX2 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
COMMD7Q86VX2 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
COMMD7Q86VX2 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COMMD7Q86VX2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
COMMD7Q86VX2 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
COMMD7Q86VX2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
COMMD7Q86VX2 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
COMMD7Q86VX2 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
COMMD7Q86VX2 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
COMMD7Q86VX2 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
COMMD7Q86VX2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
COMMD7Q86VX2 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
COMMD7Q86VX2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
COMMD7Q86VX2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
COMMD7Q86VX2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COMMD7Q86VX2 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COMMD7Q86VX2 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COMMD7Q86VX2 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COMMD7Q86VX2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COMMD7Q86VX2 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COMMD7Q86VX2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COMMD7Q86VX2 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COMMD7Q86VX2 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COMMD7Q86VX2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COMMD7Q86VX2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
COMMD7Q86VX2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
COMMD7Q86VX2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
COMMD7Q86VX2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COMMD7Q86VX2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COMMD7Q86VX2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COMMD7Q86VX2 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COMMD7Q86VX2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COMMD7Q86VX2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COMMD7Q86VX2 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
COMMD7Q86VX2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
COMMD7Q86VX2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COMMD7Q86VX2 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COMMD7Q86VX2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
COMMD7Q86VX2 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
COMMD7Q86VX2 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
COMMD7Q86VX2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COMMD7Q86VX2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COMMD7Q86VX2 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
COMMD7Q86VX2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COMMD7Q86VX2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COMMD7Q86VX2 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COMMD7Q86VX2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COMMD7Q86VX2 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
COMMD7Q86VX2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COMMD7Q86VX2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COMMD7Q86VX2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COMMD7Q86VX2 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COMMD7Q86VX2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COMMD7Q86VX2 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COMMD7Q86VX2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
COMMD7Q86VX2 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COMMD7Q86VX2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
COMMD7Q86VX2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COMMD7Q86VX2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COMMD7Q86VX2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COMMD7Q86VX2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COMMD7Q86VX2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COMMD7Q86VX2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COMMD7Q86VX2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
COMMD7Q86VX2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COMMD7Q86VX2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COMMD7Q86VX2 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COMMD7Q86VX2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COMMD7Q86VX2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COMMD7Q86VX2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COMMD7Q86VX2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COMMD7Q86VX2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
COMMD7Q86VX2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COMMD7Q86VX2 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COMMD7Q86VX2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COMMD7Q86VX2 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COMMD7Q86VX2 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COMMD7Q86VX2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COMMD7Q86VX2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COMMD7Q86VX2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COMMD7Q86VX2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COMMD7Q86VX2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COMMD7Q86VX2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COMMD7Q86VX2 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
COMMD7Q86VX2 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COMMD7Q86VX2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
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