Protein–RNA interactions for Protein: Q5JX69

FAM209B, Protein FAM209B, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM209BQ5JX69 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FAM209BQ5JX69 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FAM209BQ5JX69 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FAM209BQ5JX69 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FAM209BQ5JX69 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FAM209BQ5JX69 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FAM209BQ5JX69 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
FAM209BQ5JX69 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FAM209BQ5JX69 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FAM209BQ5JX69 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FAM209BQ5JX69 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FAM209BQ5JX69 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM209BQ5JX69 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM209BQ5JX69 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAM209BQ5JX69 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FAM209BQ5JX69 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FAM209BQ5JX69 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM209BQ5JX69 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM209BQ5JX69 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FAM209BQ5JX69 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FAM209BQ5JX69 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM209BQ5JX69 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM209BQ5JX69 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM209BQ5JX69 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM209BQ5JX69 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM209BQ5JX69 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM209BQ5JX69 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM209BQ5JX69 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM209BQ5JX69 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM209BQ5JX69 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM209BQ5JX69 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM209BQ5JX69 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM209BQ5JX69 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM209BQ5JX69 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM209BQ5JX69 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM209BQ5JX69 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM209BQ5JX69 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FAM209BQ5JX69 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM209BQ5JX69 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM209BQ5JX69 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM209BQ5JX69 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM209BQ5JX69 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM209BQ5JX69 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM209BQ5JX69 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM209BQ5JX69 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM209BQ5JX69 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM209BQ5JX69 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM209BQ5JX69 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM209BQ5JX69 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM209BQ5JX69 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM209BQ5JX69 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM209BQ5JX69 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM209BQ5JX69 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM209BQ5JX69 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM209BQ5JX69 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM209BQ5JX69 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
FAM209BQ5JX69 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM209BQ5JX69 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM209BQ5JX69 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM209BQ5JX69 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM209BQ5JX69 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM209BQ5JX69 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM209BQ5JX69 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM209BQ5JX69 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM209BQ5JX69 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM209BQ5JX69 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM209BQ5JX69 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM209BQ5JX69 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM209BQ5JX69 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM209BQ5JX69 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM209BQ5JX69 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM209BQ5JX69 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM209BQ5JX69 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM209BQ5JX69 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM209BQ5JX69 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM209BQ5JX69 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM209BQ5JX69 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM209BQ5JX69 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM209BQ5JX69 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM209BQ5JX69 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM209BQ5JX69 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM209BQ5JX69 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM209BQ5JX69 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM209BQ5JX69 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM209BQ5JX69 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM209BQ5JX69 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM209BQ5JX69 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM209BQ5JX69 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM209BQ5JX69 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM209BQ5JX69 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM209BQ5JX69 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM209BQ5JX69 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM209BQ5JX69 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM209BQ5JX69 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM209BQ5JX69 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM209BQ5JX69 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM209BQ5JX69 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM209BQ5JX69 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM209BQ5JX69 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM209BQ5JX69 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms