Protein–RNA interactions for Protein: Q56NI9

ESCO2, N-acetyltransferase ESCO2, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESCO2Q56NI9 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ESCO2Q56NI9 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ESCO2Q56NI9 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ESCO2Q56NI9 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ESCO2Q56NI9 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ESCO2Q56NI9 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ESCO2Q56NI9 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ESCO2Q56NI9 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ESCO2Q56NI9 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ESCO2Q56NI9 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ESCO2Q56NI9 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
ESCO2Q56NI9 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ESCO2Q56NI9 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ESCO2Q56NI9 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ESCO2Q56NI9 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ESCO2Q56NI9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ESCO2Q56NI9 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ESCO2Q56NI9 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ESCO2Q56NI9 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ESCO2Q56NI9 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ESCO2Q56NI9 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ESCO2Q56NI9 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ESCO2Q56NI9 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ESCO2Q56NI9 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ESCO2Q56NI9 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ESCO2Q56NI9 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ESCO2Q56NI9 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ESCO2Q56NI9 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ESCO2Q56NI9 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ESCO2Q56NI9 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ESCO2Q56NI9 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ESCO2Q56NI9 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ESCO2Q56NI9 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ESCO2Q56NI9 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ESCO2Q56NI9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ESCO2Q56NI9 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ESCO2Q56NI9 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ESCO2Q56NI9 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ESCO2Q56NI9 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ESCO2Q56NI9 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ESCO2Q56NI9 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ESCO2Q56NI9 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ESCO2Q56NI9 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ESCO2Q56NI9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ESCO2Q56NI9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ESCO2Q56NI9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ESCO2Q56NI9 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ESCO2Q56NI9 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ESCO2Q56NI9 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ESCO2Q56NI9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ESCO2Q56NI9 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ESCO2Q56NI9 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ESCO2Q56NI9 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ESCO2Q56NI9 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ESCO2Q56NI9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ESCO2Q56NI9 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ESCO2Q56NI9 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ESCO2Q56NI9 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ESCO2Q56NI9 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ESCO2Q56NI9 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ESCO2Q56NI9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ESCO2Q56NI9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ESCO2Q56NI9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ESCO2Q56NI9 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ESCO2Q56NI9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ESCO2Q56NI9 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ESCO2Q56NI9 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ESCO2Q56NI9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ESCO2Q56NI9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ESCO2Q56NI9 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ESCO2Q56NI9 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ESCO2Q56NI9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ESCO2Q56NI9 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ESCO2Q56NI9 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ESCO2Q56NI9 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ESCO2Q56NI9 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ESCO2Q56NI9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ESCO2Q56NI9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ESCO2Q56NI9 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ESCO2Q56NI9 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ESCO2Q56NI9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ESCO2Q56NI9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ESCO2Q56NI9 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ESCO2Q56NI9 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ESCO2Q56NI9 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ESCO2Q56NI9 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ESCO2Q56NI9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ESCO2Q56NI9 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ESCO2Q56NI9 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ESCO2Q56NI9 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ESCO2Q56NI9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ESCO2Q56NI9 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ESCO2Q56NI9 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ESCO2Q56NI9 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ESCO2Q56NI9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ESCO2Q56NI9 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ESCO2Q56NI9 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ESCO2Q56NI9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ESCO2Q56NI9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ESCO2Q56NI9 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms