Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAM9

TUSC1, Tumor suppressor candidate gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUSC1Q2TAM9 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TUSC1Q2TAM9 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
TUSC1Q2TAM9 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TUSC1Q2TAM9 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
TUSC1Q2TAM9 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TUSC1Q2TAM9 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TUSC1Q2TAM9 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TUSC1Q2TAM9 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TUSC1Q2TAM9 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TUSC1Q2TAM9 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TUSC1Q2TAM9 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TUSC1Q2TAM9 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TUSC1Q2TAM9 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TUSC1Q2TAM9 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TUSC1Q2TAM9 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TUSC1Q2TAM9 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
TUSC1Q2TAM9 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TUSC1Q2TAM9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TUSC1Q2TAM9 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TUSC1Q2TAM9 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TUSC1Q2TAM9 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
TUSC1Q2TAM9 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TUSC1Q2TAM9 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TUSC1Q2TAM9 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TUSC1Q2TAM9 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TUSC1Q2TAM9 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TUSC1Q2TAM9 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TUSC1Q2TAM9 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TUSC1Q2TAM9 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TUSC1Q2TAM9 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TUSC1Q2TAM9 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TUSC1Q2TAM9 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TUSC1Q2TAM9 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TUSC1Q2TAM9 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TUSC1Q2TAM9 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TUSC1Q2TAM9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TUSC1Q2TAM9 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TUSC1Q2TAM9 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TUSC1Q2TAM9 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TUSC1Q2TAM9 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TUSC1Q2TAM9 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TUSC1Q2TAM9 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TUSC1Q2TAM9 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TUSC1Q2TAM9 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TUSC1Q2TAM9 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TUSC1Q2TAM9 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TUSC1Q2TAM9 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TUSC1Q2TAM9 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TUSC1Q2TAM9 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TUSC1Q2TAM9 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TUSC1Q2TAM9 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TUSC1Q2TAM9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TUSC1Q2TAM9 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TUSC1Q2TAM9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUSC1Q2TAM9 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUSC1Q2TAM9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TUSC1Q2TAM9 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TUSC1Q2TAM9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TUSC1Q2TAM9 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TUSC1Q2TAM9 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TUSC1Q2TAM9 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TUSC1Q2TAM9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TUSC1Q2TAM9 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TUSC1Q2TAM9 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TUSC1Q2TAM9 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TUSC1Q2TAM9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TUSC1Q2TAM9 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TUSC1Q2TAM9 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TUSC1Q2TAM9 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TUSC1Q2TAM9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUSC1Q2TAM9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TUSC1Q2TAM9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TUSC1Q2TAM9 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TUSC1Q2TAM9 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TUSC1Q2TAM9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUSC1Q2TAM9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TUSC1Q2TAM9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUSC1Q2TAM9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUSC1Q2TAM9 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUSC1Q2TAM9 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TUSC1Q2TAM9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TUSC1Q2TAM9 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TUSC1Q2TAM9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TUSC1Q2TAM9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUSC1Q2TAM9 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUSC1Q2TAM9 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TUSC1Q2TAM9 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUSC1Q2TAM9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TUSC1Q2TAM9 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TUSC1Q2TAM9 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUSC1Q2TAM9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TUSC1Q2TAM9 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUSC1Q2TAM9 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUSC1Q2TAM9 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TUSC1Q2TAM9 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUSC1Q2TAM9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUSC1Q2TAM9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TUSC1Q2TAM9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUSC1Q2TAM9 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUSC1Q2TAM9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms