Protein–RNA interactions for Protein: Q15742

NAB2, NGFI-A-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAB2Q15742 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC37.26■■■■□ 3.56
NAB2Q15742 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC36.27■■■■□ 3.4
NAB2Q15742 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
NAB2Q15742 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
NAB2Q15742 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
NAB2Q15742 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
NAB2Q15742 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
NAB2Q15742 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
NAB2Q15742 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
NAB2Q15742 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
NAB2Q15742 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC35.04■■■■□ 3.2
NAB2Q15742 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
NAB2Q15742 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
NAB2Q15742 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
NAB2Q15742 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
NAB2Q15742 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
NAB2Q15742 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
NAB2Q15742 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
NAB2Q15742 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
NAB2Q15742 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
NAB2Q15742 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
NAB2Q15742 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
NAB2Q15742 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
NAB2Q15742 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
NAB2Q15742 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
NAB2Q15742 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
NAB2Q15742 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
NAB2Q15742 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
NAB2Q15742 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
NAB2Q15742 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC33.69■■■□□ 2.98
NAB2Q15742 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
NAB2Q15742 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
NAB2Q15742 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
NAB2Q15742 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
NAB2Q15742 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
NAB2Q15742 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
NAB2Q15742 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.95
NAB2Q15742 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
NAB2Q15742 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
NAB2Q15742 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
NAB2Q15742 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
NAB2Q15742 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
NAB2Q15742 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
NAB2Q15742 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
NAB2Q15742 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
NAB2Q15742 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
NAB2Q15742 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
NAB2Q15742 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
NAB2Q15742 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
NAB2Q15742 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
NAB2Q15742 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
NAB2Q15742 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
NAB2Q15742 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
NAB2Q15742 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
NAB2Q15742 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
NAB2Q15742 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
NAB2Q15742 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
NAB2Q15742 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
NAB2Q15742 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
NAB2Q15742 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
NAB2Q15742 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
NAB2Q15742 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
NAB2Q15742 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
NAB2Q15742 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
NAB2Q15742 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
NAB2Q15742 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
NAB2Q15742 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
NAB2Q15742 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
NAB2Q15742 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
NAB2Q15742 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
NAB2Q15742 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
NAB2Q15742 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
NAB2Q15742 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
NAB2Q15742 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
NAB2Q15742 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
NAB2Q15742 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
NAB2Q15742 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
NAB2Q15742 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
NAB2Q15742 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
NAB2Q15742 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC32.02■■■□□ 2.72
NAB2Q15742 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
NAB2Q15742 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
NAB2Q15742 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
NAB2Q15742 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
NAB2Q15742 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
NAB2Q15742 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
NAB2Q15742 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
NAB2Q15742 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC31.89■■■□□ 2.7
NAB2Q15742 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
NAB2Q15742 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
NAB2Q15742 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
NAB2Q15742 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
NAB2Q15742 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
NAB2Q15742 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
NAB2Q15742 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
NAB2Q15742 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
NAB2Q15742 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
NAB2Q15742 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
NAB2Q15742 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
NAB2Q15742 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms