Protein–RNA interactions for Protein: P55055

NR1H2, Oxysterols receptor LXR-beta, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H2P55055 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.96■■■□□ 2.71
NR1H2P55055 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
NR1H2P55055 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.03■■■□□ 2.56
NR1H2P55055 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
NR1H2P55055 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NR1H2P55055 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
NR1H2P55055 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
NR1H2P55055 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NR1H2P55055 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
NR1H2P55055 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NR1H2P55055 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NR1H2P55055 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NR1H2P55055 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NR1H2P55055 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NR1H2P55055 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NR1H2P55055 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NR1H2P55055 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NR1H2P55055 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NR1H2P55055 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NR1H2P55055 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NR1H2P55055 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NR1H2P55055 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NR1H2P55055 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NR1H2P55055 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NR1H2P55055 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NR1H2P55055 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
NR1H2P55055 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NR1H2P55055 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NR1H2P55055 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NR1H2P55055 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NR1H2P55055 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NR1H2P55055 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NR1H2P55055 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NR1H2P55055 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NR1H2P55055 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NR1H2P55055 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NR1H2P55055 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NR1H2P55055 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NR1H2P55055 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NR1H2P55055 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NR1H2P55055 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NR1H2P55055 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NR1H2P55055 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NR1H2P55055 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NR1H2P55055 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NR1H2P55055 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NR1H2P55055 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NR1H2P55055 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NR1H2P55055 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NR1H2P55055 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NR1H2P55055 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NR1H2P55055 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NR1H2P55055 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NR1H2P55055 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NR1H2P55055 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NR1H2P55055 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NR1H2P55055 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NR1H2P55055 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NR1H2P55055 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NR1H2P55055 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NR1H2P55055 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NR1H2P55055 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NR1H2P55055 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NR1H2P55055 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NR1H2P55055 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NR1H2P55055 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NR1H2P55055 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NR1H2P55055 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NR1H2P55055 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NR1H2P55055 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NR1H2P55055 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NR1H2P55055 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
NR1H2P55055 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NR1H2P55055 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NR1H2P55055 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NR1H2P55055 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NR1H2P55055 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NR1H2P55055 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NR1H2P55055 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NR1H2P55055 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NR1H2P55055 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NR1H2P55055 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NR1H2P55055 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NR1H2P55055 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NR1H2P55055 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NR1H2P55055 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NR1H2P55055 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NR1H2P55055 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NR1H2P55055 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NR1H2P55055 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NR1H2P55055 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NR1H2P55055 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NR1H2P55055 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NR1H2P55055 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NR1H2P55055 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NR1H2P55055 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NR1H2P55055 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NR1H2P55055 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NR1H2P55055 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NR1H2P55055 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.8 ms