Protein–RNA interactions for Protein: P51812

RPS6KA3, Ribosomal protein S6 kinase alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA3P51812 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.1■■■□□ 2.73
RPS6KA3P51812 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.54■■■□□ 2.64
RPS6KA3P51812 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.53
RPS6KA3P51812 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
RPS6KA3P51812 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
RPS6KA3P51812 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
RPS6KA3P51812 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
RPS6KA3P51812 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
RPS6KA3P51812 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
RPS6KA3P51812 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
RPS6KA3P51812 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
RPS6KA3P51812 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
RPS6KA3P51812 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RPS6KA3P51812 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RPS6KA3P51812 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RPS6KA3P51812 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RPS6KA3P51812 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
RPS6KA3P51812 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RPS6KA3P51812 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RPS6KA3P51812 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RPS6KA3P51812 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RPS6KA3P51812 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RPS6KA3P51812 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
RPS6KA3P51812 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RPS6KA3P51812 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RPS6KA3P51812 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RPS6KA3P51812 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RPS6KA3P51812 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RPS6KA3P51812 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RPS6KA3P51812 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RPS6KA3P51812 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RPS6KA3P51812 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RPS6KA3P51812 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RPS6KA3P51812 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RPS6KA3P51812 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
RPS6KA3P51812 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RPS6KA3P51812 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RPS6KA3P51812 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RPS6KA3P51812 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RPS6KA3P51812 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RPS6KA3P51812 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RPS6KA3P51812 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RPS6KA3P51812 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RPS6KA3P51812 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RPS6KA3P51812 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RPS6KA3P51812 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RPS6KA3P51812 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RPS6KA3P51812 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RPS6KA3P51812 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RPS6KA3P51812 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RPS6KA3P51812 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RPS6KA3P51812 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RPS6KA3P51812 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RPS6KA3P51812 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RPS6KA3P51812 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RPS6KA3P51812 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RPS6KA3P51812 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RPS6KA3P51812 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RPS6KA3P51812 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
RPS6KA3P51812 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RPS6KA3P51812 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RPS6KA3P51812 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RPS6KA3P51812 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RPS6KA3P51812 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RPS6KA3P51812 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RPS6KA3P51812 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RPS6KA3P51812 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RPS6KA3P51812 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RPS6KA3P51812 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RPS6KA3P51812 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RPS6KA3P51812 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RPS6KA3P51812 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RPS6KA3P51812 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RPS6KA3P51812 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RPS6KA3P51812 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RPS6KA3P51812 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RPS6KA3P51812 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RPS6KA3P51812 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RPS6KA3P51812 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RPS6KA3P51812 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RPS6KA3P51812 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.57■■■□□ 2
RPS6KA3P51812 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RPS6KA3P51812 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RPS6KA3P51812 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RPS6KA3P51812 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RPS6KA3P51812 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RPS6KA3P51812 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RPS6KA3P51812 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RPS6KA3P51812 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RPS6KA3P51812 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RPS6KA3P51812 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RPS6KA3P51812 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RPS6KA3P51812 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RPS6KA3P51812 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RPS6KA3P51812 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RPS6KA3P51812 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RPS6KA3P51812 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RPS6KA3P51812 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RPS6KA3P51812 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RPS6KA3P51812 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms