Protein–RNA interactions for Protein: P50851

LRBA, Lipopolysaccharide-responsive and beige-like anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,863 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRBAP50851 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
LRBAP50851 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
LRBAP50851 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
LRBAP50851 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LRBAP50851 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LRBAP50851 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LRBAP50851 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LRBAP50851 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LRBAP50851 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LRBAP50851 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LRBAP50851 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LRBAP50851 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRBAP50851 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRBAP50851 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
LRBAP50851 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LRBAP50851 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRBAP50851 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
LRBAP50851 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRBAP50851 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
LRBAP50851 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRBAP50851 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRBAP50851 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRBAP50851 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRBAP50851 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
LRBAP50851 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRBAP50851 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRBAP50851 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRBAP50851 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRBAP50851 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRBAP50851 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRBAP50851 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRBAP50851 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRBAP50851 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRBAP50851 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRBAP50851 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRBAP50851 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRBAP50851 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRBAP50851 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LRBAP50851 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
LRBAP50851 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
LRBAP50851 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRBAP50851 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRBAP50851 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRBAP50851 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRBAP50851 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
LRBAP50851 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRBAP50851 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRBAP50851 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRBAP50851 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRBAP50851 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRBAP50851 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
LRBAP50851 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRBAP50851 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRBAP50851 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRBAP50851 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRBAP50851 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRBAP50851 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRBAP50851 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRBAP50851 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRBAP50851 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRBAP50851 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRBAP50851 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRBAP50851 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRBAP50851 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LRBAP50851 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRBAP50851 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LRBAP50851 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LRBAP50851 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LRBAP50851 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LRBAP50851 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LRBAP50851 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LRBAP50851 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LRBAP50851 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LRBAP50851 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRBAP50851 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRBAP50851 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRBAP50851 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRBAP50851 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRBAP50851 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
LRBAP50851 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRBAP50851 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRBAP50851 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRBAP50851 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRBAP50851 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRBAP50851 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRBAP50851 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRBAP50851 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
LRBAP50851 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRBAP50851 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRBAP50851 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRBAP50851 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRBAP50851 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
LRBAP50851 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
LRBAP50851 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRBAP50851 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRBAP50851 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRBAP50851 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRBAP50851 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRBAP50851 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRBAP50851 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms