Protein–RNA interactions for Protein: O60830

TIMM17B, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17-B, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM17BO60830 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TIMM17BO60830 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TIMM17BO60830 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TIMM17BO60830 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TIMM17BO60830 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TIMM17BO60830 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TIMM17BO60830 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TIMM17BO60830 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TIMM17BO60830 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TIMM17BO60830 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TIMM17BO60830 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TIMM17BO60830 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TIMM17BO60830 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TIMM17BO60830 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TIMM17BO60830 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TIMM17BO60830 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TIMM17BO60830 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TIMM17BO60830 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TIMM17BO60830 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TIMM17BO60830 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TIMM17BO60830 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TIMM17BO60830 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TIMM17BO60830 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TIMM17BO60830 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TIMM17BO60830 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TIMM17BO60830 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TIMM17BO60830 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TIMM17BO60830 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TIMM17BO60830 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TIMM17BO60830 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TIMM17BO60830 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TIMM17BO60830 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TIMM17BO60830 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TIMM17BO60830 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TIMM17BO60830 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TIMM17BO60830 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TIMM17BO60830 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TIMM17BO60830 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TIMM17BO60830 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TIMM17BO60830 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TIMM17BO60830 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TIMM17BO60830 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TIMM17BO60830 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TIMM17BO60830 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TIMM17BO60830 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TIMM17BO60830 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TIMM17BO60830 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TIMM17BO60830 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TIMM17BO60830 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TIMM17BO60830 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TIMM17BO60830 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TIMM17BO60830 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TIMM17BO60830 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TIMM17BO60830 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TIMM17BO60830 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TIMM17BO60830 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TIMM17BO60830 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TIMM17BO60830 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TIMM17BO60830 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TIMM17BO60830 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TIMM17BO60830 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TIMM17BO60830 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TIMM17BO60830 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TIMM17BO60830 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TIMM17BO60830 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TIMM17BO60830 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TIMM17BO60830 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TIMM17BO60830 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TIMM17BO60830 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TIMM17BO60830 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TIMM17BO60830 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TIMM17BO60830 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TIMM17BO60830 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TIMM17BO60830 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TIMM17BO60830 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TIMM17BO60830 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TIMM17BO60830 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TIMM17BO60830 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TIMM17BO60830 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TIMM17BO60830 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TIMM17BO60830 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TIMM17BO60830 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TIMM17BO60830 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TIMM17BO60830 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TIMM17BO60830 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TIMM17BO60830 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TIMM17BO60830 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TIMM17BO60830 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TIMM17BO60830 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
TIMM17BO60830 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TIMM17BO60830 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TIMM17BO60830 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TIMM17BO60830 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TIMM17BO60830 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TIMM17BO60830 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TIMM17BO60830 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TIMM17BO60830 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TIMM17BO60830 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TIMM17BO60830 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TIMM17BO60830 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms