Protein–RNA interactions for Protein: O00750

PIK3C2B, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C2BO00750 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC50.5■■■■■ 5.68
PIK3C2BO00750 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC50.22■■■■■ 5.63
PIK3C2BO00750 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC49.6■■■■■ 5.53
PIK3C2BO00750 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.32■■■■■ 5.49
PIK3C2BO00750 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.88■■■■■ 5.42
PIK3C2BO00750 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.62■■■■■ 5.37
PIK3C2BO00750 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.49■■■■■ 5.35
PIK3C2BO00750 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC48.27■■■■■ 5.32
PIK3C2BO00750 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.05■■■■■ 5.28
PIK3C2BO00750 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC47.96■■■■■ 5.27
PIK3C2BO00750 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.86■■■■■ 5.25
PIK3C2BO00750 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC47.79■■■■■ 5.24
PIK3C2BO00750 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC47.72■■■■■ 5.23
PIK3C2BO00750 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC47.67■■■■■ 5.22
PIK3C2BO00750 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.26■■■■■ 5.16
PIK3C2BO00750 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47.21■■■■■ 5.15
PIK3C2BO00750 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.2■■■■■ 5.15
PIK3C2BO00750 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC47.2■■■■■ 5.15
PIK3C2BO00750 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.05■■■■■ 5.12
PIK3C2BO00750 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC46.77■■■■■ 5.08
PIK3C2BO00750 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.59■■■■■ 5.05
PIK3C2BO00750 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC46.59■■■■■ 5.05
PIK3C2BO00750 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.5■■■■■ 5.04
PIK3C2BO00750 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.39■■■■■ 5.02
PIK3C2BO00750 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC46.39■■■■■ 5.02
PIK3C2BO00750 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.36■■■■■ 5.01
PIK3C2BO00750 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.34■■■■■ 5.01
PIK3C2BO00750 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.33■■■■■ 5.01
PIK3C2BO00750 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC46.3■■■■■ 5
PIK3C2BO00750 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC46.14■■■■■ 4.98
PIK3C2BO00750 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.14■■■■■ 4.98
PIK3C2BO00750 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC46.01■■■■■ 4.96
PIK3C2BO00750 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC45.82■■■■■ 4.93
PIK3C2BO00750 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC45.81■■■■■ 4.92
PIK3C2BO00750 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC45.8■■■■■ 4.92
PIK3C2BO00750 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC45.49■■■■■ 4.87
PIK3C2BO00750 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC45.43■■■■■ 4.86
PIK3C2BO00750 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.38■■■■■ 4.86
PIK3C2BO00750 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.33■■■■■ 4.85
PIK3C2BO00750 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC45.1■■■■■ 4.81
PIK3C2BO00750 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC45.06■■■■■ 4.8
PIK3C2BO00750 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC44.9■■■■■ 4.78
PIK3C2BO00750 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC44.83■■■■■ 4.77
PIK3C2BO00750 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.74■■■■■ 4.75
PIK3C2BO00750 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.71■■■■■ 4.75
PIK3C2BO00750 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC44.7■■■■■ 4.75
PIK3C2BO00750 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.6■■■■■ 4.73
PIK3C2BO00750 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC44.54■■■■■ 4.72
PIK3C2BO00750 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC44.51■■■■■ 4.72
PIK3C2BO00750 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.51■■■■■ 4.72
PIK3C2BO00750 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC44.45■■■■■ 4.71
PIK3C2BO00750 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.44■■■■■ 4.7
PIK3C2BO00750 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC44.3■■■■■ 4.68
PIK3C2BO00750 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC44.3■■■■■ 4.68
PIK3C2BO00750 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.29■■■■■ 4.68
PIK3C2BO00750 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.24■■■■■ 4.67
PIK3C2BO00750 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
PIK3C2BO00750 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC44.22■■■■■ 4.67
PIK3C2BO00750 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC44.2■■■■■ 4.67
PIK3C2BO00750 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC44.17■■■■■ 4.66
PIK3C2BO00750 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC44.17■■■■■ 4.66
PIK3C2BO00750 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC44.15■■■■■ 4.66
PIK3C2BO00750 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
PIK3C2BO00750 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.03■■■■■ 4.64
PIK3C2BO00750 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC43.92■■■■■ 4.62
PIK3C2BO00750 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.9■■■■■ 4.62
PIK3C2BO00750 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.86■■■■■ 4.61
PIK3C2BO00750 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC43.84■■■■■ 4.61
PIK3C2BO00750 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC43.82■■■■■ 4.61
PIK3C2BO00750 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.75■■■■■ 4.59
PIK3C2BO00750 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC43.73■■■■■ 4.59
PIK3C2BO00750 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.71■■■■■ 4.59
PIK3C2BO00750 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.68■■■■■ 4.58
PIK3C2BO00750 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
PIK3C2BO00750 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
PIK3C2BO00750 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.65■■■■■ 4.58
PIK3C2BO00750 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.61■■■■■ 4.57
PIK3C2BO00750 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC43.58■■■■■ 4.57
PIK3C2BO00750 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.55■■■■■ 4.56
PIK3C2BO00750 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC43.55■■■■■ 4.56
PIK3C2BO00750 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
PIK3C2BO00750 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC43.51■■■■■ 4.56
PIK3C2BO00750 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC43.51■■■■■ 4.56
PIK3C2BO00750 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC43.51■■■■■ 4.56
PIK3C2BO00750 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
PIK3C2BO00750 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.54
PIK3C2BO00750 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
PIK3C2BO00750 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC43.4■■■■■ 4.54
PIK3C2BO00750 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43.37■■■■■ 4.53
PIK3C2BO00750 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.34■■■■■ 4.53
PIK3C2BO00750 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC43.27■■■■■ 4.52
PIK3C2BO00750 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC43.27■■■■■ 4.52
PIK3C2BO00750 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC43.22■■■■■ 4.51
PIK3C2BO00750 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC43.22■■■■■ 4.51
PIK3C2BO00750 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.19■■■■■ 4.5
PIK3C2BO00750 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC43.18■■■■■ 4.5
PIK3C2BO00750 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
PIK3C2BO00750 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC43.16■■■■■ 4.5
PIK3C2BO00750 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
PIK3C2BO00750 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms