Protein–RNA interactions for Protein: O00750

PIK3C2B, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C2BO00750 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC43.14■■■■■ 4.5
PIK3C2BO00750 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC43.1■■■■■ 4.49
PIK3C2BO00750 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43.09■■■■■ 4.49
PIK3C2BO00750 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC43.08■■■■■ 4.49
PIK3C2BO00750 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.48
PIK3C2BO00750 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.04■■■■■ 4.48
PIK3C2BO00750 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
PIK3C2BO00750 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC42.97■■■■■ 4.47
PIK3C2BO00750 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC42.97■■■■■ 4.47
PIK3C2BO00750 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC42.93■■■■■ 4.46
PIK3C2BO00750 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.92■■■■■ 4.46
PIK3C2BO00750 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.9■■■■■ 4.46
PIK3C2BO00750 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
PIK3C2BO00750 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.85■■■■■ 4.45
PIK3C2BO00750 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC42.84■■■■■ 4.45
PIK3C2BO00750 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC42.84■■■■■ 4.45
PIK3C2BO00750 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC42.84■■■■■ 4.45
PIK3C2BO00750 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
PIK3C2BO00750 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC42.75■■■■■ 4.43
PIK3C2BO00750 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC42.75■■■■■ 4.43
PIK3C2BO00750 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC42.71■■■■■ 4.43
PIK3C2BO00750 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.61■■■■■ 4.41
PIK3C2BO00750 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
PIK3C2BO00750 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC42.56■■■■■ 4.4
PIK3C2BO00750 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
PIK3C2BO00750 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
PIK3C2BO00750 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
PIK3C2BO00750 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC42.42■■■■■ 4.38
PIK3C2BO00750 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
PIK3C2BO00750 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
PIK3C2BO00750 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.37
PIK3C2BO00750 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC42.37■■■■■ 4.37
PIK3C2BO00750 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
PIK3C2BO00750 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC42.35■■■■■ 4.37
PIK3C2BO00750 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC42.35■■■■■ 4.37
PIK3C2BO00750 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC42.35■■■■■ 4.37
PIK3C2BO00750 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC42.31■■■■■ 4.36
PIK3C2BO00750 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
PIK3C2BO00750 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC42.25■■■■■ 4.35
PIK3C2BO00750 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
PIK3C2BO00750 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
PIK3C2BO00750 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.21■■■■■ 4.35
PIK3C2BO00750 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC42.17■■■■■ 4.34
PIK3C2BO00750 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC42.15■■■■■ 4.34
PIK3C2BO00750 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC42.14■■■■■ 4.34
PIK3C2BO00750 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.12■■■■■ 4.33
PIK3C2BO00750 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
PIK3C2BO00750 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
PIK3C2BO00750 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC42.08■■■■■ 4.33
PIK3C2BO00750 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC42.07■■■■■ 4.33
PIK3C2BO00750 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC42.06■■■■■ 4.32
PIK3C2BO00750 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC42.05■■■■■ 4.32
PIK3C2BO00750 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
PIK3C2BO00750 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC42.02■■■■■ 4.32
PIK3C2BO00750 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
PIK3C2BO00750 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC41.99■■■■■ 4.31
PIK3C2BO00750 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
PIK3C2BO00750 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
PIK3C2BO00750 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC41.96■■■■■ 4.31
PIK3C2BO00750 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC41.95■■■■■ 4.31
PIK3C2BO00750 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
PIK3C2BO00750 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
PIK3C2BO00750 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC41.83■■■■■ 4.29
PIK3C2BO00750 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
PIK3C2BO00750 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC41.81■■■■■ 4.28
PIK3C2BO00750 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.8■■■■■ 4.28
PIK3C2BO00750 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC41.74■■■■■ 4.27
PIK3C2BO00750 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
PIK3C2BO00750 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC41.69■■■■■ 4.26
PIK3C2BO00750 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
PIK3C2BO00750 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
PIK3C2BO00750 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
PIK3C2BO00750 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.6■■■■■ 4.25
PIK3C2BO00750 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC41.6■■■■■ 4.25
PIK3C2BO00750 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
PIK3C2BO00750 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
PIK3C2BO00750 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC41.55■■■■■ 4.24
PIK3C2BO00750 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.54■■■■■ 4.24
PIK3C2BO00750 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC41.51■■■■■ 4.23
PIK3C2BO00750 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC41.5■■■■■ 4.23
PIK3C2BO00750 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
PIK3C2BO00750 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC41.47■■■■■ 4.23
PIK3C2BO00750 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
PIK3C2BO00750 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC41.43■■■■■ 4.22
PIK3C2BO00750 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
PIK3C2BO00750 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
PIK3C2BO00750 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC41.4■■■■■ 4.22
PIK3C2BO00750 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
PIK3C2BO00750 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.38■■■■■ 4.21
PIK3C2BO00750 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
PIK3C2BO00750 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
PIK3C2BO00750 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.21
PIK3C2BO00750 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC41.32■■■■■ 4.2
PIK3C2BO00750 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC41.31■■■■■ 4.2
PIK3C2BO00750 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC41.31■■■■■ 4.2
PIK3C2BO00750 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
PIK3C2BO00750 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC41.29■■■■■ 4.2
PIK3C2BO00750 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
PIK3C2BO00750 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.27■■■■■ 4.2
PIK3C2BO00750 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC41.27■■■■■ 4.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms