Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PS18

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PS18 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
A0A1W2PS18 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
A0A1W2PS18 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
A0A1W2PS18 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
A0A1W2PS18 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A1W2PS18 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
A0A1W2PS18 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
A0A1W2PS18 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
A0A1W2PS18 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
A0A1W2PS18 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
A0A1W2PS18 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
A0A1W2PS18 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
A0A1W2PS18 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
A0A1W2PS18 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
A0A1W2PS18 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
A0A1W2PS18 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
A0A1W2PS18 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
A0A1W2PS18 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A1W2PS18 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A1W2PS18 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A1W2PS18 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
A0A1W2PS18 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
A0A1W2PS18 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
A0A1W2PS18 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
A0A1W2PS18 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
A0A1W2PS18 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
A0A1W2PS18 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
A0A1W2PS18 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
A0A1W2PS18 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
A0A1W2PS18 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
A0A1W2PS18 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A1W2PS18 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
A0A1W2PS18 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
A0A1W2PS18 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
A0A1W2PS18 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
A0A1W2PS18 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
A0A1W2PS18 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
A0A1W2PS18 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A1W2PS18 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A1W2PS18 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A1W2PS18 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A1W2PS18 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A1W2PS18 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A1W2PS18 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A1W2PS18 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A1W2PS18 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A1W2PS18 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A1W2PS18 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A1W2PS18 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A1W2PS18 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A1W2PS18 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A1W2PS18 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A1W2PS18 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A1W2PS18 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A1W2PS18 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A1W2PS18 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A1W2PS18 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A1W2PS18 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A1W2PS18 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A1W2PS18 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A1W2PS18 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A1W2PS18 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A1W2PS18 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A1W2PS18 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A1W2PS18 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A1W2PS18 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A1W2PS18 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A1W2PS18 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A1W2PS18 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
A0A1W2PS18 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A1W2PS18 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A1W2PS18 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A1W2PS18 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A1W2PS18 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A1W2PS18 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
A0A1W2PS18 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
A0A1W2PS18 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A1W2PS18 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A1W2PS18 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A1W2PS18 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A1W2PS18 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A1W2PS18 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A1W2PS18 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A1W2PS18 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A1W2PS18 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A1W2PS18 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A1W2PS18 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A1W2PS18 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A1W2PS18 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
A0A1W2PS18 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A1W2PS18 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A1W2PS18 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A1W2PS18 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A1W2PS18 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A1W2PS18 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A1W2PS18 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1W2PS18 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1W2PS18 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1W2PS18 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A1W2PS18 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms