Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
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