Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y8

PRG3, Proteoglycan 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG3Q9Y2Y8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRG3Q9Y2Y8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRG3Q9Y2Y8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRG3Q9Y2Y8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRG3Q9Y2Y8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRG3Q9Y2Y8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRG3Q9Y2Y8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRG3Q9Y2Y8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRG3Q9Y2Y8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRG3Q9Y2Y8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRG3Q9Y2Y8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRG3Q9Y2Y8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PRG3Q9Y2Y8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRG3Q9Y2Y8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRG3Q9Y2Y8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRG3Q9Y2Y8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRG3Q9Y2Y8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PRG3Q9Y2Y8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PRG3Q9Y2Y8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRG3Q9Y2Y8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRG3Q9Y2Y8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRG3Q9Y2Y8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRG3Q9Y2Y8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRG3Q9Y2Y8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRG3Q9Y2Y8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRG3Q9Y2Y8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRG3Q9Y2Y8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRG3Q9Y2Y8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PRG3Q9Y2Y8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRG3Q9Y2Y8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRG3Q9Y2Y8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRG3Q9Y2Y8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PRG3Q9Y2Y8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRG3Q9Y2Y8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRG3Q9Y2Y8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRG3Q9Y2Y8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRG3Q9Y2Y8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRG3Q9Y2Y8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRG3Q9Y2Y8 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRG3Q9Y2Y8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRG3Q9Y2Y8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRG3Q9Y2Y8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PRG3Q9Y2Y8 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRG3Q9Y2Y8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRG3Q9Y2Y8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRG3Q9Y2Y8 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRG3Q9Y2Y8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRG3Q9Y2Y8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRG3Q9Y2Y8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRG3Q9Y2Y8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRG3Q9Y2Y8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRG3Q9Y2Y8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRG3Q9Y2Y8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRG3Q9Y2Y8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRG3Q9Y2Y8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRG3Q9Y2Y8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PRG3Q9Y2Y8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PRG3Q9Y2Y8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRG3Q9Y2Y8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRG3Q9Y2Y8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
PRG3Q9Y2Y8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRG3Q9Y2Y8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRG3Q9Y2Y8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRG3Q9Y2Y8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRG3Q9Y2Y8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRG3Q9Y2Y8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRG3Q9Y2Y8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRG3Q9Y2Y8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRG3Q9Y2Y8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRG3Q9Y2Y8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRG3Q9Y2Y8 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRG3Q9Y2Y8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PRG3Q9Y2Y8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRG3Q9Y2Y8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRG3Q9Y2Y8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRG3Q9Y2Y8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRG3Q9Y2Y8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRG3Q9Y2Y8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRG3Q9Y2Y8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRG3Q9Y2Y8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRG3Q9Y2Y8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRG3Q9Y2Y8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRG3Q9Y2Y8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRG3Q9Y2Y8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRG3Q9Y2Y8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRG3Q9Y2Y8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRG3Q9Y2Y8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRG3Q9Y2Y8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRG3Q9Y2Y8 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRG3Q9Y2Y8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRG3Q9Y2Y8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRG3Q9Y2Y8 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRG3Q9Y2Y8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRG3Q9Y2Y8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRG3Q9Y2Y8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRG3Q9Y2Y8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRG3Q9Y2Y8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
PRG3Q9Y2Y8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PRG3Q9Y2Y8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRG3Q9Y2Y8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms