Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC4

MCTS1, Malignant T-cell-amplified sequence 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTS1Q9ULC4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MCTS1Q9ULC4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCTS1Q9ULC4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCTS1Q9ULC4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCTS1Q9ULC4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCTS1Q9ULC4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCTS1Q9ULC4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCTS1Q9ULC4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCTS1Q9ULC4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCTS1Q9ULC4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCTS1Q9ULC4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCTS1Q9ULC4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MCTS1Q9ULC4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCTS1Q9ULC4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCTS1Q9ULC4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCTS1Q9ULC4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MCTS1Q9ULC4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCTS1Q9ULC4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCTS1Q9ULC4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCTS1Q9ULC4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MCTS1Q9ULC4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCTS1Q9ULC4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCTS1Q9ULC4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCTS1Q9ULC4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCTS1Q9ULC4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCTS1Q9ULC4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MCTS1Q9ULC4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCTS1Q9ULC4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCTS1Q9ULC4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCTS1Q9ULC4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCTS1Q9ULC4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCTS1Q9ULC4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCTS1Q9ULC4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCTS1Q9ULC4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCTS1Q9ULC4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCTS1Q9ULC4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCTS1Q9ULC4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCTS1Q9ULC4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCTS1Q9ULC4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCTS1Q9ULC4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCTS1Q9ULC4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCTS1Q9ULC4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCTS1Q9ULC4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCTS1Q9ULC4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCTS1Q9ULC4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCTS1Q9ULC4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCTS1Q9ULC4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCTS1Q9ULC4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCTS1Q9ULC4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCTS1Q9ULC4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCTS1Q9ULC4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCTS1Q9ULC4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCTS1Q9ULC4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCTS1Q9ULC4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCTS1Q9ULC4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCTS1Q9ULC4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCTS1Q9ULC4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCTS1Q9ULC4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCTS1Q9ULC4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCTS1Q9ULC4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCTS1Q9ULC4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCTS1Q9ULC4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCTS1Q9ULC4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCTS1Q9ULC4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCTS1Q9ULC4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCTS1Q9ULC4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCTS1Q9ULC4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCTS1Q9ULC4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCTS1Q9ULC4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCTS1Q9ULC4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCTS1Q9ULC4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCTS1Q9ULC4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCTS1Q9ULC4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCTS1Q9ULC4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCTS1Q9ULC4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCTS1Q9ULC4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCTS1Q9ULC4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCTS1Q9ULC4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCTS1Q9ULC4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCTS1Q9ULC4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCTS1Q9ULC4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCTS1Q9ULC4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCTS1Q9ULC4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCTS1Q9ULC4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCTS1Q9ULC4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MCTS1Q9ULC4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MCTS1Q9ULC4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MCTS1Q9ULC4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MCTS1Q9ULC4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MCTS1Q9ULC4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCTS1Q9ULC4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCTS1Q9ULC4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCTS1Q9ULC4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCTS1Q9ULC4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCTS1Q9ULC4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCTS1Q9ULC4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCTS1Q9ULC4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCTS1Q9ULC4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCTS1Q9ULC4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCTS1Q9ULC4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms