Protein–RNA interactions for Protein: Q9UID3

VPS51, Vacuolar protein sorting-associated protein 51 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS51Q9UID3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VPS51Q9UID3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
VPS51Q9UID3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VPS51Q9UID3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VPS51Q9UID3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VPS51Q9UID3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VPS51Q9UID3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VPS51Q9UID3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VPS51Q9UID3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
VPS51Q9UID3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VPS51Q9UID3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VPS51Q9UID3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VPS51Q9UID3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VPS51Q9UID3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VPS51Q9UID3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VPS51Q9UID3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VPS51Q9UID3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VPS51Q9UID3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VPS51Q9UID3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VPS51Q9UID3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VPS51Q9UID3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VPS51Q9UID3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VPS51Q9UID3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VPS51Q9UID3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VPS51Q9UID3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
VPS51Q9UID3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
VPS51Q9UID3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VPS51Q9UID3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
VPS51Q9UID3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
VPS51Q9UID3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
VPS51Q9UID3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VPS51Q9UID3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
VPS51Q9UID3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
VPS51Q9UID3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VPS51Q9UID3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VPS51Q9UID3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VPS51Q9UID3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VPS51Q9UID3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
VPS51Q9UID3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VPS51Q9UID3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
VPS51Q9UID3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VPS51Q9UID3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VPS51Q9UID3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VPS51Q9UID3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VPS51Q9UID3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VPS51Q9UID3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VPS51Q9UID3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VPS51Q9UID3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VPS51Q9UID3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VPS51Q9UID3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VPS51Q9UID3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VPS51Q9UID3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VPS51Q9UID3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
VPS51Q9UID3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
VPS51Q9UID3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
VPS51Q9UID3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VPS51Q9UID3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VPS51Q9UID3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VPS51Q9UID3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VPS51Q9UID3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VPS51Q9UID3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VPS51Q9UID3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VPS51Q9UID3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VPS51Q9UID3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VPS51Q9UID3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VPS51Q9UID3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VPS51Q9UID3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VPS51Q9UID3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VPS51Q9UID3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VPS51Q9UID3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VPS51Q9UID3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VPS51Q9UID3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VPS51Q9UID3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VPS51Q9UID3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VPS51Q9UID3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VPS51Q9UID3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VPS51Q9UID3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VPS51Q9UID3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VPS51Q9UID3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VPS51Q9UID3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VPS51Q9UID3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
VPS51Q9UID3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VPS51Q9UID3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VPS51Q9UID3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VPS51Q9UID3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VPS51Q9UID3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VPS51Q9UID3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VPS51Q9UID3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VPS51Q9UID3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VPS51Q9UID3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VPS51Q9UID3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
VPS51Q9UID3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VPS51Q9UID3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
VPS51Q9UID3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VPS51Q9UID3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VPS51Q9UID3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VPS51Q9UID3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VPS51Q9UID3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VPS51Q9UID3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VPS51Q9UID3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms