Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW1

SEC31B, Protein transport protein Sec31B, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31BQ9NQW1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
SEC31BQ9NQW1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
SEC31BQ9NQW1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
SEC31BQ9NQW1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
SEC31BQ9NQW1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
SEC31BQ9NQW1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
SEC31BQ9NQW1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
SEC31BQ9NQW1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
SEC31BQ9NQW1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
SEC31BQ9NQW1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
SEC31BQ9NQW1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
SEC31BQ9NQW1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
SEC31BQ9NQW1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
SEC31BQ9NQW1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
SEC31BQ9NQW1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
SEC31BQ9NQW1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
SEC31BQ9NQW1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
SEC31BQ9NQW1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
SEC31BQ9NQW1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
SEC31BQ9NQW1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
SEC31BQ9NQW1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
SEC31BQ9NQW1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
SEC31BQ9NQW1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
SEC31BQ9NQW1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
SEC31BQ9NQW1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
SEC31BQ9NQW1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
SEC31BQ9NQW1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
SEC31BQ9NQW1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
SEC31BQ9NQW1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
SEC31BQ9NQW1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
SEC31BQ9NQW1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
SEC31BQ9NQW1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
SEC31BQ9NQW1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
SEC31BQ9NQW1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
SEC31BQ9NQW1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
SEC31BQ9NQW1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
SEC31BQ9NQW1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
SEC31BQ9NQW1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
SEC31BQ9NQW1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
SEC31BQ9NQW1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
SEC31BQ9NQW1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
SEC31BQ9NQW1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
SEC31BQ9NQW1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
SEC31BQ9NQW1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
SEC31BQ9NQW1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
SEC31BQ9NQW1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
SEC31BQ9NQW1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
SEC31BQ9NQW1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
SEC31BQ9NQW1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
SEC31BQ9NQW1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
SEC31BQ9NQW1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
SEC31BQ9NQW1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
SEC31BQ9NQW1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
SEC31BQ9NQW1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
SEC31BQ9NQW1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
SEC31BQ9NQW1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
SEC31BQ9NQW1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
SEC31BQ9NQW1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
SEC31BQ9NQW1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
SEC31BQ9NQW1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
SEC31BQ9NQW1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
SEC31BQ9NQW1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
SEC31BQ9NQW1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
SEC31BQ9NQW1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
SEC31BQ9NQW1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
SEC31BQ9NQW1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
SEC31BQ9NQW1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
SEC31BQ9NQW1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
SEC31BQ9NQW1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
SEC31BQ9NQW1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
SEC31BQ9NQW1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
SEC31BQ9NQW1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
SEC31BQ9NQW1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
SEC31BQ9NQW1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SEC31BQ9NQW1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SEC31BQ9NQW1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
SEC31BQ9NQW1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
SEC31BQ9NQW1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
SEC31BQ9NQW1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
SEC31BQ9NQW1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
SEC31BQ9NQW1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SEC31BQ9NQW1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
SEC31BQ9NQW1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SEC31BQ9NQW1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SEC31BQ9NQW1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
SEC31BQ9NQW1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
SEC31BQ9NQW1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
SEC31BQ9NQW1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
SEC31BQ9NQW1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
SEC31BQ9NQW1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
SEC31BQ9NQW1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
SEC31BQ9NQW1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
SEC31BQ9NQW1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
SEC31BQ9NQW1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
SEC31BQ9NQW1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
SEC31BQ9NQW1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
SEC31BQ9NQW1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
SEC31BQ9NQW1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
SEC31BQ9NQW1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
SEC31BQ9NQW1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms