Protein–RNA interactions for Protein: Q96PD5

PGLYRP2, N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGLYRP2Q96PD5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PGLYRP2Q96PD5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PGLYRP2Q96PD5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PGLYRP2Q96PD5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PGLYRP2Q96PD5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PGLYRP2Q96PD5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PGLYRP2Q96PD5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PGLYRP2Q96PD5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PGLYRP2Q96PD5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PGLYRP2Q96PD5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PGLYRP2Q96PD5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PGLYRP2Q96PD5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PGLYRP2Q96PD5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PGLYRP2Q96PD5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PGLYRP2Q96PD5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PGLYRP2Q96PD5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PGLYRP2Q96PD5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PGLYRP2Q96PD5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PGLYRP2Q96PD5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PGLYRP2Q96PD5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PGLYRP2Q96PD5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PGLYRP2Q96PD5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PGLYRP2Q96PD5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PGLYRP2Q96PD5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PGLYRP2Q96PD5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PGLYRP2Q96PD5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PGLYRP2Q96PD5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PGLYRP2Q96PD5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PGLYRP2Q96PD5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PGLYRP2Q96PD5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PGLYRP2Q96PD5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PGLYRP2Q96PD5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PGLYRP2Q96PD5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PGLYRP2Q96PD5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PGLYRP2Q96PD5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PGLYRP2Q96PD5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PGLYRP2Q96PD5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PGLYRP2Q96PD5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PGLYRP2Q96PD5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PGLYRP2Q96PD5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PGLYRP2Q96PD5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PGLYRP2Q96PD5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PGLYRP2Q96PD5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PGLYRP2Q96PD5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PGLYRP2Q96PD5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PGLYRP2Q96PD5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PGLYRP2Q96PD5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PGLYRP2Q96PD5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PGLYRP2Q96PD5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PGLYRP2Q96PD5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
PGLYRP2Q96PD5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PGLYRP2Q96PD5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PGLYRP2Q96PD5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PGLYRP2Q96PD5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PGLYRP2Q96PD5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PGLYRP2Q96PD5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PGLYRP2Q96PD5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PGLYRP2Q96PD5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PGLYRP2Q96PD5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PGLYRP2Q96PD5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PGLYRP2Q96PD5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PGLYRP2Q96PD5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PGLYRP2Q96PD5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PGLYRP2Q96PD5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PGLYRP2Q96PD5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PGLYRP2Q96PD5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PGLYRP2Q96PD5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PGLYRP2Q96PD5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PGLYRP2Q96PD5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PGLYRP2Q96PD5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PGLYRP2Q96PD5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PGLYRP2Q96PD5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PGLYRP2Q96PD5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PGLYRP2Q96PD5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PGLYRP2Q96PD5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PGLYRP2Q96PD5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PGLYRP2Q96PD5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PGLYRP2Q96PD5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PGLYRP2Q96PD5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PGLYRP2Q96PD5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PGLYRP2Q96PD5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PGLYRP2Q96PD5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PGLYRP2Q96PD5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PGLYRP2Q96PD5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PGLYRP2Q96PD5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PGLYRP2Q96PD5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PGLYRP2Q96PD5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PGLYRP2Q96PD5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PGLYRP2Q96PD5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PGLYRP2Q96PD5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PGLYRP2Q96PD5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PGLYRP2Q96PD5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PGLYRP2Q96PD5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PGLYRP2Q96PD5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PGLYRP2Q96PD5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
PGLYRP2Q96PD5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PGLYRP2Q96PD5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PGLYRP2Q96PD5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PGLYRP2Q96PD5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PGLYRP2Q96PD5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms