Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT9

RNPC3, RNA-binding protein 40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPC3Q96LT9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RNPC3Q96LT9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RNPC3Q96LT9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RNPC3Q96LT9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RNPC3Q96LT9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RNPC3Q96LT9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RNPC3Q96LT9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RNPC3Q96LT9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RNPC3Q96LT9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RNPC3Q96LT9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RNPC3Q96LT9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RNPC3Q96LT9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RNPC3Q96LT9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RNPC3Q96LT9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RNPC3Q96LT9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RNPC3Q96LT9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
RNPC3Q96LT9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RNPC3Q96LT9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RNPC3Q96LT9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RNPC3Q96LT9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RNPC3Q96LT9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
RNPC3Q96LT9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RNPC3Q96LT9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RNPC3Q96LT9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RNPC3Q96LT9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RNPC3Q96LT9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
RNPC3Q96LT9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RNPC3Q96LT9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RNPC3Q96LT9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RNPC3Q96LT9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RNPC3Q96LT9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RNPC3Q96LT9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RNPC3Q96LT9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RNPC3Q96LT9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RNPC3Q96LT9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RNPC3Q96LT9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RNPC3Q96LT9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RNPC3Q96LT9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RNPC3Q96LT9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RNPC3Q96LT9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
RNPC3Q96LT9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RNPC3Q96LT9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RNPC3Q96LT9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RNPC3Q96LT9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RNPC3Q96LT9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RNPC3Q96LT9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RNPC3Q96LT9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RNPC3Q96LT9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RNPC3Q96LT9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RNPC3Q96LT9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RNPC3Q96LT9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RNPC3Q96LT9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
RNPC3Q96LT9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RNPC3Q96LT9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RNPC3Q96LT9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RNPC3Q96LT9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RNPC3Q96LT9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RNPC3Q96LT9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RNPC3Q96LT9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RNPC3Q96LT9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RNPC3Q96LT9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RNPC3Q96LT9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RNPC3Q96LT9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RNPC3Q96LT9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
RNPC3Q96LT9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RNPC3Q96LT9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RNPC3Q96LT9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RNPC3Q96LT9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RNPC3Q96LT9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RNPC3Q96LT9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RNPC3Q96LT9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RNPC3Q96LT9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RNPC3Q96LT9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
RNPC3Q96LT9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RNPC3Q96LT9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RNPC3Q96LT9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RNPC3Q96LT9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RNPC3Q96LT9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RNPC3Q96LT9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RNPC3Q96LT9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RNPC3Q96LT9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RNPC3Q96LT9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RNPC3Q96LT9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RNPC3Q96LT9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RNPC3Q96LT9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RNPC3Q96LT9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
RNPC3Q96LT9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RNPC3Q96LT9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RNPC3Q96LT9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
RNPC3Q96LT9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RNPC3Q96LT9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RNPC3Q96LT9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RNPC3Q96LT9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RNPC3Q96LT9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RNPC3Q96LT9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
RNPC3Q96LT9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
RNPC3Q96LT9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
RNPC3Q96LT9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RNPC3Q96LT9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RNPC3Q96LT9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms