RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617223.1

KLF16-204, Transcript of Kruppel like factor 16, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KLF16, Length 1,133 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF16-204ENST00000617223 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.84■■■■■ 7.17
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KLF16-204ENST00000617223 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.82■■■■■ 5.73
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KLF16-204ENST00000617223 DCAF8L2P0C7V8 631 aa50.48■■■■■ 5.67
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KLF16-204ENST00000617223 SMARCA2P51531 1590 aa46.47■■■■■ 5.03
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KLF16-204ENST00000617223 CUX2O14529 1486 aa45.74■■■■■ 4.91
KLF16-204ENST00000617223 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.56■■■■■ 4.88
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KLF16-204ENST00000617223 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.78■■■■■ 4.76
KLF16-204ENST00000617223 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.76■■■■■ 4.76
KLF16-204ENST00000617223 WDR62O43379 1518 aa44.73■■■■■ 4.75
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KLF16-204ENST00000617223 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.34■■■■■ 4.69
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KLF16-204ENST00000617223 ABCC8Q09428 1581 aa43.92■■■■■ 4.62
KLF16-204ENST00000617223 IFT140Q96RY7 1462 aa43.87■■■■■ 4.61
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KLF16-204ENST00000617223 OSCARQ8IYS5 282 aa43.79■■■■■ 4.6
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KLF16-204ENST00000617223 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.51■■■■■ 4.56
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KLF16-204ENST00000617223 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.29■■■■■ 4.52
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KLF16-204ENST00000617223 WDR97A6NE52 1622 aa43.09■■■■■ 4.49
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KLF16-204ENST00000617223 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa43.08■■■■■ 4.49
KLF16-204ENST00000617223 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa43.08■■■■■ 4.49
KLF16-204ENST00000617223 ARHGEF11O15085 1522 aa43■■■■■ 4.47
KLF16-204ENST00000617223 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.97■■■■■ 4.47
KLF16-204ENST00000617223 GRIN2BQ13224 1484 aa42.93■■■■■ 4.46
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KLF16-204ENST00000617223 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.82■■■■■ 4.45
KLF16-204ENST00000617223 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.82■■■■■ 4.45
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KLF16-204ENST00000617223 PBRM1Q86U86 1689 aa42.73■■■■■ 4.43
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KLF16-204ENST00000617223 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.29■■■■■ 4.36
KLF16-204ENST00000617223 NUP160Q12769 1436 aa42.2■■■■■ 4.35
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KLF16-204ENST00000617223 CEP170Q5SW79 1584 aa42.17■■■■■ 4.34
KLF16-204ENST00000617223 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.99■■■■■ 4.31
KLF16-204ENST00000617223 SHROOM2Q13796 1616 aa41.95■■■■■ 4.31
KLF16-204ENST00000617223 KIF27Q86VH2 1401 aa41.93■■■■■ 4.3
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KLF16-204ENST00000617223 JPH4Q96JJ6 628 aa41.84■■■■■ 4.29
KLF16-204ENST00000617223 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP41.8■■■■■ 4.28
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