Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEU8

APPL2, DCC-interacting protein 13-beta, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APPL2Q8NEU8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
APPL2Q8NEU8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
APPL2Q8NEU8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
APPL2Q8NEU8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
APPL2Q8NEU8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
APPL2Q8NEU8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
APPL2Q8NEU8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
APPL2Q8NEU8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
APPL2Q8NEU8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
APPL2Q8NEU8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
APPL2Q8NEU8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
APPL2Q8NEU8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
APPL2Q8NEU8 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
APPL2Q8NEU8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
APPL2Q8NEU8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
APPL2Q8NEU8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
APPL2Q8NEU8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
APPL2Q8NEU8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
APPL2Q8NEU8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
APPL2Q8NEU8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
APPL2Q8NEU8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
APPL2Q8NEU8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
APPL2Q8NEU8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
APPL2Q8NEU8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
APPL2Q8NEU8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
APPL2Q8NEU8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
APPL2Q8NEU8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
APPL2Q8NEU8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
APPL2Q8NEU8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
APPL2Q8NEU8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
APPL2Q8NEU8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
APPL2Q8NEU8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
APPL2Q8NEU8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
APPL2Q8NEU8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
APPL2Q8NEU8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
APPL2Q8NEU8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
APPL2Q8NEU8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
APPL2Q8NEU8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
APPL2Q8NEU8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
APPL2Q8NEU8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
APPL2Q8NEU8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
APPL2Q8NEU8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
APPL2Q8NEU8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
APPL2Q8NEU8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
APPL2Q8NEU8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
APPL2Q8NEU8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
APPL2Q8NEU8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
APPL2Q8NEU8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
APPL2Q8NEU8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
APPL2Q8NEU8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
APPL2Q8NEU8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
APPL2Q8NEU8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
APPL2Q8NEU8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
APPL2Q8NEU8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
APPL2Q8NEU8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
APPL2Q8NEU8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
APPL2Q8NEU8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
APPL2Q8NEU8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
APPL2Q8NEU8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
APPL2Q8NEU8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
APPL2Q8NEU8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
APPL2Q8NEU8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
APPL2Q8NEU8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
APPL2Q8NEU8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
APPL2Q8NEU8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
APPL2Q8NEU8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
APPL2Q8NEU8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
APPL2Q8NEU8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
APPL2Q8NEU8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
APPL2Q8NEU8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
APPL2Q8NEU8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
APPL2Q8NEU8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
APPL2Q8NEU8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
APPL2Q8NEU8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
APPL2Q8NEU8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
APPL2Q8NEU8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
APPL2Q8NEU8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
APPL2Q8NEU8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
APPL2Q8NEU8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
APPL2Q8NEU8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
APPL2Q8NEU8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
APPL2Q8NEU8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
APPL2Q8NEU8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
APPL2Q8NEU8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
APPL2Q8NEU8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
APPL2Q8NEU8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
APPL2Q8NEU8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
APPL2Q8NEU8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
APPL2Q8NEU8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
APPL2Q8NEU8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
APPL2Q8NEU8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
APPL2Q8NEU8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
APPL2Q8NEU8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
APPL2Q8NEU8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
APPL2Q8NEU8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
APPL2Q8NEU8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
APPL2Q8NEU8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
APPL2Q8NEU8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
APPL2Q8NEU8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
APPL2Q8NEU8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82 ms