Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEU8

APPL2, DCC-interacting protein 13-beta, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APPL2Q8NEU8 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC36.83■■■■□ 3.49
APPL2Q8NEU8 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
APPL2Q8NEU8 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC35.9■■■■□ 3.34
APPL2Q8NEU8 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
APPL2Q8NEU8 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
APPL2Q8NEU8 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
APPL2Q8NEU8 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
APPL2Q8NEU8 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.26■■■■□ 3.24
APPL2Q8NEU8 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
APPL2Q8NEU8 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
APPL2Q8NEU8 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
APPL2Q8NEU8 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
APPL2Q8NEU8 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
APPL2Q8NEU8 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
APPL2Q8NEU8 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
APPL2Q8NEU8 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
APPL2Q8NEU8 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
APPL2Q8NEU8 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
APPL2Q8NEU8 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
APPL2Q8NEU8 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
APPL2Q8NEU8 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
APPL2Q8NEU8 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
APPL2Q8NEU8 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
APPL2Q8NEU8 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
APPL2Q8NEU8 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
APPL2Q8NEU8 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
APPL2Q8NEU8 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
APPL2Q8NEU8 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
APPL2Q8NEU8 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
APPL2Q8NEU8 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
APPL2Q8NEU8 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
APPL2Q8NEU8 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
APPL2Q8NEU8 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
APPL2Q8NEU8 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
APPL2Q8NEU8 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
APPL2Q8NEU8 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
APPL2Q8NEU8 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
APPL2Q8NEU8 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
APPL2Q8NEU8 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
APPL2Q8NEU8 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
APPL2Q8NEU8 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
APPL2Q8NEU8 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
APPL2Q8NEU8 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
APPL2Q8NEU8 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
APPL2Q8NEU8 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
APPL2Q8NEU8 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
APPL2Q8NEU8 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
APPL2Q8NEU8 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
APPL2Q8NEU8 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.51■■■□□ 2.79
APPL2Q8NEU8 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
APPL2Q8NEU8 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
APPL2Q8NEU8 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
APPL2Q8NEU8 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
APPL2Q8NEU8 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
APPL2Q8NEU8 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
APPL2Q8NEU8 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
APPL2Q8NEU8 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
APPL2Q8NEU8 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
APPL2Q8NEU8 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
APPL2Q8NEU8 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
APPL2Q8NEU8 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
APPL2Q8NEU8 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
APPL2Q8NEU8 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
APPL2Q8NEU8 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
APPL2Q8NEU8 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
APPL2Q8NEU8 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
APPL2Q8NEU8 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
APPL2Q8NEU8 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.75■■■□□ 2.67
APPL2Q8NEU8 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.66
APPL2Q8NEU8 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
APPL2Q8NEU8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
APPL2Q8NEU8 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
APPL2Q8NEU8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
APPL2Q8NEU8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
APPL2Q8NEU8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
APPL2Q8NEU8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
APPL2Q8NEU8 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
APPL2Q8NEU8 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
APPL2Q8NEU8 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
APPL2Q8NEU8 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
APPL2Q8NEU8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
APPL2Q8NEU8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
APPL2Q8NEU8 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
APPL2Q8NEU8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
APPL2Q8NEU8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
APPL2Q8NEU8 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
APPL2Q8NEU8 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
APPL2Q8NEU8 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
APPL2Q8NEU8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
APPL2Q8NEU8 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
APPL2Q8NEU8 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
APPL2Q8NEU8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
APPL2Q8NEU8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
APPL2Q8NEU8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
APPL2Q8NEU8 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
APPL2Q8NEU8 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
APPL2Q8NEU8 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
APPL2Q8NEU8 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
APPL2Q8NEU8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
APPL2Q8NEU8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms