Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVV2

LOXHD1, Lipoxygenase homology domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,947 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXHD1Q8IVV2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LOXHD1Q8IVV2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LOXHD1Q8IVV2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LOXHD1Q8IVV2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LOXHD1Q8IVV2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LOXHD1Q8IVV2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LOXHD1Q8IVV2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LOXHD1Q8IVV2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
LOXHD1Q8IVV2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LOXHD1Q8IVV2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LOXHD1Q8IVV2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
LOXHD1Q8IVV2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LOXHD1Q8IVV2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LOXHD1Q8IVV2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LOXHD1Q8IVV2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LOXHD1Q8IVV2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LOXHD1Q8IVV2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LOXHD1Q8IVV2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LOXHD1Q8IVV2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LOXHD1Q8IVV2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LOXHD1Q8IVV2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LOXHD1Q8IVV2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LOXHD1Q8IVV2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LOXHD1Q8IVV2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LOXHD1Q8IVV2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LOXHD1Q8IVV2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LOXHD1Q8IVV2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LOXHD1Q8IVV2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LOXHD1Q8IVV2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LOXHD1Q8IVV2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LOXHD1Q8IVV2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
LOXHD1Q8IVV2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LOXHD1Q8IVV2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LOXHD1Q8IVV2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
LOXHD1Q8IVV2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
LOXHD1Q8IVV2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LOXHD1Q8IVV2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LOXHD1Q8IVV2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LOXHD1Q8IVV2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LOXHD1Q8IVV2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LOXHD1Q8IVV2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LOXHD1Q8IVV2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LOXHD1Q8IVV2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LOXHD1Q8IVV2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LOXHD1Q8IVV2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LOXHD1Q8IVV2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LOXHD1Q8IVV2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LOXHD1Q8IVV2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LOXHD1Q8IVV2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LOXHD1Q8IVV2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
LOXHD1Q8IVV2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LOXHD1Q8IVV2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
LOXHD1Q8IVV2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LOXHD1Q8IVV2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LOXHD1Q8IVV2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LOXHD1Q8IVV2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LOXHD1Q8IVV2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
LOXHD1Q8IVV2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
LOXHD1Q8IVV2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LOXHD1Q8IVV2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LOXHD1Q8IVV2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LOXHD1Q8IVV2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LOXHD1Q8IVV2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LOXHD1Q8IVV2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LOXHD1Q8IVV2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LOXHD1Q8IVV2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
LOXHD1Q8IVV2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LOXHD1Q8IVV2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LOXHD1Q8IVV2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LOXHD1Q8IVV2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LOXHD1Q8IVV2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LOXHD1Q8IVV2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LOXHD1Q8IVV2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LOXHD1Q8IVV2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LOXHD1Q8IVV2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LOXHD1Q8IVV2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LOXHD1Q8IVV2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LOXHD1Q8IVV2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LOXHD1Q8IVV2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LOXHD1Q8IVV2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LOXHD1Q8IVV2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LOXHD1Q8IVV2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LOXHD1Q8IVV2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LOXHD1Q8IVV2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LOXHD1Q8IVV2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LOXHD1Q8IVV2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
LOXHD1Q8IVV2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LOXHD1Q8IVV2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LOXHD1Q8IVV2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LOXHD1Q8IVV2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LOXHD1Q8IVV2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LOXHD1Q8IVV2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LOXHD1Q8IVV2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LOXHD1Q8IVV2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LOXHD1Q8IVV2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LOXHD1Q8IVV2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LOXHD1Q8IVV2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LOXHD1Q8IVV2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LOXHD1Q8IVV2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LOXHD1Q8IVV2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms