Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVV2

LOXHD1, Lipoxygenase homology domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,947 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXHD1Q8IVV2 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC38.01■■■■□ 3.68
LOXHD1Q8IVV2 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
LOXHD1Q8IVV2 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
LOXHD1Q8IVV2 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
LOXHD1Q8IVV2 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC37.05■■■■□ 3.52
LOXHD1Q8IVV2 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
LOXHD1Q8IVV2 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
LOXHD1Q8IVV2 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
LOXHD1Q8IVV2 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.69■■■■□ 3.46
LOXHD1Q8IVV2 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
LOXHD1Q8IVV2 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
LOXHD1Q8IVV2 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
LOXHD1Q8IVV2 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
LOXHD1Q8IVV2 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
LOXHD1Q8IVV2 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.3
LOXHD1Q8IVV2 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
LOXHD1Q8IVV2 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC35.59■■■■□ 3.29
LOXHD1Q8IVV2 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC35.54■■■■□ 3.28
LOXHD1Q8IVV2 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
LOXHD1Q8IVV2 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
LOXHD1Q8IVV2 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
LOXHD1Q8IVV2 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
LOXHD1Q8IVV2 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
LOXHD1Q8IVV2 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
LOXHD1Q8IVV2 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
LOXHD1Q8IVV2 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
LOXHD1Q8IVV2 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
LOXHD1Q8IVV2 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
LOXHD1Q8IVV2 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
LOXHD1Q8IVV2 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
LOXHD1Q8IVV2 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
LOXHD1Q8IVV2 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
LOXHD1Q8IVV2 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
LOXHD1Q8IVV2 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
LOXHD1Q8IVV2 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
LOXHD1Q8IVV2 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
LOXHD1Q8IVV2 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
LOXHD1Q8IVV2 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC34.2■■■■□ 3.07
LOXHD1Q8IVV2 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
LOXHD1Q8IVV2 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
LOXHD1Q8IVV2 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
LOXHD1Q8IVV2 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
LOXHD1Q8IVV2 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
LOXHD1Q8IVV2 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
LOXHD1Q8IVV2 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
LOXHD1Q8IVV2 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
LOXHD1Q8IVV2 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
LOXHD1Q8IVV2 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
LOXHD1Q8IVV2 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
LOXHD1Q8IVV2 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
LOXHD1Q8IVV2 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
LOXHD1Q8IVV2 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
LOXHD1Q8IVV2 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
LOXHD1Q8IVV2 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
LOXHD1Q8IVV2 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
LOXHD1Q8IVV2 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
LOXHD1Q8IVV2 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
LOXHD1Q8IVV2 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
LOXHD1Q8IVV2 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
LOXHD1Q8IVV2 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
LOXHD1Q8IVV2 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
LOXHD1Q8IVV2 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
LOXHD1Q8IVV2 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
LOXHD1Q8IVV2 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
LOXHD1Q8IVV2 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
LOXHD1Q8IVV2 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
LOXHD1Q8IVV2 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
LOXHD1Q8IVV2 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
LOXHD1Q8IVV2 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
LOXHD1Q8IVV2 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
LOXHD1Q8IVV2 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
LOXHD1Q8IVV2 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
LOXHD1Q8IVV2 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
LOXHD1Q8IVV2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
LOXHD1Q8IVV2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
LOXHD1Q8IVV2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
LOXHD1Q8IVV2 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
LOXHD1Q8IVV2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
LOXHD1Q8IVV2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
LOXHD1Q8IVV2 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
LOXHD1Q8IVV2 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.75■■■□□ 2.83
LOXHD1Q8IVV2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
LOXHD1Q8IVV2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
LOXHD1Q8IVV2 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
LOXHD1Q8IVV2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
LOXHD1Q8IVV2 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC32.68■■■□□ 2.82
LOXHD1Q8IVV2 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
LOXHD1Q8IVV2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
LOXHD1Q8IVV2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
LOXHD1Q8IVV2 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
LOXHD1Q8IVV2 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
LOXHD1Q8IVV2 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
LOXHD1Q8IVV2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
LOXHD1Q8IVV2 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
LOXHD1Q8IVV2 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
LOXHD1Q8IVV2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
LOXHD1Q8IVV2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
LOXHD1Q8IVV2 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
LOXHD1Q8IVV2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
LOXHD1Q8IVV2 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms