Protein–RNA interactions for Protein: Q86VH4

LRRTM4, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4Q86VH4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRTM4Q86VH4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRTM4Q86VH4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRTM4Q86VH4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRTM4Q86VH4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRTM4Q86VH4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRTM4Q86VH4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRTM4Q86VH4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRTM4Q86VH4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRTM4Q86VH4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRTM4Q86VH4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRTM4Q86VH4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRTM4Q86VH4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRTM4Q86VH4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRTM4Q86VH4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRTM4Q86VH4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRTM4Q86VH4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRTM4Q86VH4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRTM4Q86VH4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRTM4Q86VH4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRTM4Q86VH4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRTM4Q86VH4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRTM4Q86VH4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRTM4Q86VH4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRTM4Q86VH4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRTM4Q86VH4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRTM4Q86VH4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRRTM4Q86VH4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRTM4Q86VH4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRTM4Q86VH4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRTM4Q86VH4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRTM4Q86VH4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRTM4Q86VH4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRTM4Q86VH4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRTM4Q86VH4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRTM4Q86VH4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRTM4Q86VH4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRTM4Q86VH4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRTM4Q86VH4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRTM4Q86VH4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRTM4Q86VH4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRTM4Q86VH4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRTM4Q86VH4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRTM4Q86VH4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRTM4Q86VH4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRTM4Q86VH4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
LRRTM4Q86VH4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRTM4Q86VH4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRTM4Q86VH4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRTM4Q86VH4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRTM4Q86VH4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRTM4Q86VH4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRTM4Q86VH4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRTM4Q86VH4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRTM4Q86VH4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRTM4Q86VH4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRTM4Q86VH4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRTM4Q86VH4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRTM4Q86VH4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRTM4Q86VH4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRTM4Q86VH4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRTM4Q86VH4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRTM4Q86VH4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRTM4Q86VH4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRTM4Q86VH4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRTM4Q86VH4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRTM4Q86VH4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRTM4Q86VH4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRTM4Q86VH4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRTM4Q86VH4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRTM4Q86VH4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRTM4Q86VH4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRTM4Q86VH4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LRRTM4Q86VH4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRTM4Q86VH4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRTM4Q86VH4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRTM4Q86VH4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRTM4Q86VH4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRTM4Q86VH4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRTM4Q86VH4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRTM4Q86VH4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRTM4Q86VH4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRTM4Q86VH4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRTM4Q86VH4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRTM4Q86VH4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRTM4Q86VH4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRTM4Q86VH4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRTM4Q86VH4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRTM4Q86VH4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRTM4Q86VH4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRTM4Q86VH4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRTM4Q86VH4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRTM4Q86VH4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRTM4Q86VH4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRTM4Q86VH4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRTM4Q86VH4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRTM4Q86VH4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRTM4Q86VH4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRTM4Q86VH4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRTM4Q86VH4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms